RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442896.1

SMARCE1P2-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene SMARCE1P2, Length 1,219 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1P2-201ENST00000442896 STON2Q8WXE9 905 aa9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 LRR1Q96L50 414 aa9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MAGEB18Q96M61 343 aa9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 SORCS2Q96PQ0 1159 aa9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CGREF1Q99674 301 aa9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MCHR1Q99705 422 aa9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 FKBP7Q9Y680 259 aa9.61□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 VSTM5A8MXK1 200 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 M0QX08 132 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 M0R3G1 203 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 M0R3H8 397 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PLPP3O14495 311 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ANGPT2O15123 496 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 FMO6PO60774 539 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PDE5AO76074 875 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 IFNA2P01563 188 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CELA3BP08861 270 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 USF1P22415 310 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ARR3P36575 388 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CAPZA2P47755 286 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MTPNP58546 118 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 HGFACQ04756 655 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PUDPQ08623 228 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 RBBP4Q09028 425 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PMS2P3Q13401 168 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 EFNB3Q15768 340 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 DUSP7Q16829 419 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PHYHD1Q5SRE7 291 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ZNF613Q6PF04 617 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 HDXQ7Z353 690 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MDP1Q86V88 176 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 RETREG3Q86VR2 466 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NUP37Q8NFH4 326 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 TXNDC15Q96J42 360 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MOGAT1Q96PD6 335 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ARHGDIGQ99819 225 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 EMC6Q9BV81 110 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PLK3Q9H4B4 646 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NPHS2Q9NP85 383 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MED29Q9NX70 200 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NOX1Q9Y5S8 564 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CUBNO60494 3623 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 SLC35F4A4IF30 521 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ZNF726A6NNF4 738 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 LRRN3E7EW58 273 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 hCG_2039718K7EN88 272 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 SEC14L2O76054 403 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 MT-ATP6P00846 226 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 OPN1SWP03999 348 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 C8BP07358 591 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 AHCYP23526 432 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 THBS4P35443 961 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NR4A2P43354 598 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NPRL3Q12980 569 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CAMK2DQ13557 499 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NFYCQ13952 458 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 SELPLGQ14242 412 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NPTX1Q15818 432 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 CARTPTQ16568 116 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PODNL1Q6PEZ8 512 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PXKQ7Z7A4 578 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ANKS4BQ8N8V4 417 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 IL17RDQ8NFM7 739 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 GPR32P1Q8NGA4 272 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 OR6N1Q8NGY5 312 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 OR5J2Q8NH18 312 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 TSPEARQ8WU66 669 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 KCNK17Q96T54 332 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 ZNF442Q9H7R0 627 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 USP22Q9UPT9 525 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 POFUT2Q9Y2G5 429 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1P2-201ENST00000442896 A0A0G2JND7 137 aa9.58□□□□□ -0.88
SMARCE1P2-201ENST00000442896 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms