RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SLC35A1P78382 337 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 TSC22D1Q15714 1073 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 FAM166AQ6J272 317 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A25Q6T423 547 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CCDC80Q76M96 950 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 GALNT5Q7Z7M9 940 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
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PRAME-210ENST00000442481 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
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PRAME-210ENST00000442481 C3orf49Q96BT1 292 aa10.26□□□□□ -0.77
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PRAME-210ENST00000442481 C19orf24Q9BVV8 132 aa10.26□□□□□ -0.77
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PRAME-210ENST00000442481 FREM1Q5H8C1 2179 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GWA3 101 aa10.24□□□□□ -0.77
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PRAME-210ENST00000442481 DHRS12A0PJE2 317 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CIB4A0PJX0 185 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZNF814B7Z6K7 855 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 RAMP1O60894 148 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 KRT36O76013 467 aa10.24□□□□□ -0.77
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PRAME-210ENST00000442481 CBLP22681 906 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 RPS5P46782 204 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 FABP6P51161 128 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 MAP2K6P52564 334 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 EFNA4P52798 201 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 IL1RL1Q01638 556 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 OR1Q1Q15612 314 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 C1orf140Q5VVS0 124 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CASP12Q6UXS9 341 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CBLL1Q75N03 491 aa10.24□□□□□ -0.77
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PRAME-210ENST00000442481 PYDC1Q8WXC3 89 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SLC35B4Q969S0 331 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 HSH2DQ96JZ2 352 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SEPHS2Q99611 448 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 MCHR1Q99705 422 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PRSS50Q9UI38 385 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 AURKCQ9UQB9 309 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 TRAPPC4Q9Y296 219 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 A0A096LNT2 108 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 LIPT2A6NK58 231 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 GPR171O14626 319 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 DNPH1O43598 174 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
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