RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 HSP90B2PQ58FF3 399 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 LINC00114Q6XXX2 140 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 DEF8Q6ZN54 512 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 CARM1Q86X55 608 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 SLC30A8Q8IWU4 369 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 FBXL14Q8N1E6 418 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 DEPDC4Q8N2C3 294 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 LRRC17Q8N6Y2 441 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 OR8J3Q8NGG0 315 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 HS6ST2Q96MM7 605 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 ZNF583Q96ND8 569 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 SLC38A2Q96QD8 506 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 CCDC134Q9H6E4 229 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 CRLF2Q9HC73 371 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 SH3GLB1Q9Y371 365 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 CORINQ9Y5Q5 1042 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 SLC35F4A4IF30 521 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 TRAPPC13A5PLN9 417 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 OR6C65A6NJZ3 312 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 PLPP3O14495 311 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 SSX4O60224 188 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 CECR9P0C854 216 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 ADORA3P0DMS8 318 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 PCSK6P29122 969 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 CALCRP30988 508 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 MDH1P40925 334 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 OR1E2P47887 323 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 MELKQ14680 651 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 MFSD13AQ14CX5 517 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 ZNF74Q16587 644 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 COQ5Q5HYK3 327 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 ANKRD16Q6P6B7 361 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 NHLRC1Q6VVB1 395 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 CCDC80Q76M96 950 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 SCAIQ8N9R8 606 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 PIK3C3Q8NEB9 887 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 OR5J2Q8NH18 312 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 OR6S1Q8NH40 331 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 PRSS27Q9BQR3 290 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 EVA1AQ9H8M9 152 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 FKRPQ9H9S5 495 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 FAM220BPB1ANY3 271 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 LY6HO94772 140 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 FUT4P22083 530 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 CAPZA2P47755 286 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 UGT2B15P54855 530 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 BIDP55957 195 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP1-1Q07627 177 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 NPRL3Q12980 569 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 VHLLQ6RSH7 139 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 NKAIN4Q8IVV8 208 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 C20orf196Q8IYI0 205 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 PFN4Q8NHR9 129 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 PROX1Q92786 737 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 FBXO17Q96EF6 278 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 BOD1Q96IK1 185 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 SH3GL1Q99961 368 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 GRIP2Q9C0E4 1043 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 PCDHAC1Q9H158 963 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 NOX3Q9HBY0 568 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 OBP2BQ9NPH6 170 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 CMTM6Q9NX76 183 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 INAFM1C9JVW0 142 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 UMPSP11172 480 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 IFNGR1P15260 489 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 B4GALT1P15291 398 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 NUDT6P53370 316 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 NAAAQ02083 359 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 ZNF544Q6NX49 715 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 ERICH5Q6P6B1 374 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 DNM1P46Q6ZS02 220 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 MDP1Q86V88 176 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 TREML1Q86YW5 311 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 ZNF525Q8N782 197 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 OR2T12Q8NG77 320 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 OR6N1Q8NGY5 312 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 TMEM255BQ8WV15 326 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 RASSF5Q8WWW0 418 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-209ENST00000439106 TPD52L3Q96J77 140 aa12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms