RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433027.5

RBM39-213, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 5

Gene RBM39, Length 611 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-213	ENST00000433027	GPR137	Q96N19	417 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	RASSF1	Q9NS23	344 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	RCE1	Q9Y256	329 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	CLCA1	A8K7I4	914 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	AHRR	A9YTQ3	701 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	LYN	P07948	512 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ACVR2A	P27037	513 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	HTR1F	P30939	366 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	CLDN15	P56746	228 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ERVK-25	P63136	954 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	TUBA4A	P68366	448 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21	2e-10	■□□□□ 10.8
RBM39-213	ENST00000433027	KLRB1	Q12918	225 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	SLC17A1	Q14916	467 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ACKR1	Q16570	336 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	KLHL22	Q53GT1	634 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	CCDC103	Q8IW40	242 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ASB10	Q8WXI3	467 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	TAAR6	Q96RI8	345 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	DDO	Q99489	341 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	PRSS37	A4D1T9	235 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF724	A8MTY0	619 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	C11orf98	E9PRG8	122 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	CXCL13	O43927	109 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	F13B	P05160	661 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	GABRA1	P14867	456 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	CRABP1	P29762	137 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	SLC15A1	P46059	708 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	PMP22	Q01453	160 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	RAB40B	Q12829	278 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	RNLS	Q5VYX0	342 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	FCRLA	Q7L513	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	TEX19	Q8NA77	164 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	OR2T4	Q8NH00	348 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	TMEM45B	Q96B21	275 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	FKBP7	Q9Y680	259 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027		A0A087WXM4	84 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027		K7EM74	188 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	IGHG1	P01857	330 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM39-213	ENST00000433027	FAM87A	P0C7U9	286 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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