RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP51A1	Q16850	503 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF613	Q6PF04	617 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CRLF2	Q9HC73	371 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0G2JND7	137 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	FBP2	O00757	339 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CHP2	O43745	196 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	OPN1SW	P03999	348 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CECR9	P0C854	216 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	THBS2	P35442	1172 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TUBA1B	P68363	451 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TUBA4A	P68366	448 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	VLDLR	P98155	873 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	NAAA	Q02083	359 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CHRNB3	Q05901	458 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	NFYC	Q13952	458 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TUBA1A	Q71U36	451 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	UEVLD	Q8IX04	471 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	HTRA1	Q92743	480 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MCHR1	Q99705	422 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ASPN	Q9BXN1	380 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRN3	E7EW58	273 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	LYPD3	O95274	346 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CRYAA	P02489	173 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	THY1	P04216	161 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	BMP4	P12644	408 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CD247	P20963	164 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PCGF2	P35227	344 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CRYBA2	P53672	197 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF525	Q8N782	197 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10A6	Q8NH74	314 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF217	Q8TC41	542 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	LRR1	Q96L50	414 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CA10	Q9NS85	328 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC35F4	A4IF30	521 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PLPP3	O14495	311 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PDE5A	O76074	875 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	MT-ATP6	P00846	226 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CBR1	P16152	277 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CALCR	P30988	508 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	EFNA4	P52798	201 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PUDP	Q08623	228 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PMS2P3	Q13401	168 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC80	Q76M96	950 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF627	Q7L945	461 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PXK	Q7Z7A4	578 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TAMM41	Q96BW9	452 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TXNDC15	Q96J42	360 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	EMC6	Q9BV81	110 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	MED29	Q9NX70	200 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FXYD1	O00168	92 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CELA3B	P08861	270 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A16	P16260	332 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	IL1RL1	Q01638	556 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	VMAC	Q2NL98	169 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NUP37	Q8NFH4	326 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5J2	Q8NH18	312 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO17	Q96EF6	278 aa		15.38	■□□□□ 0.05

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