RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PHF19Q5T6S3 580 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LIPNQ5VXI9 398 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC6A19Q695T7 634 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RHBDD2Q6NTF9 364 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADGRG3Q86Y34 549 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MS4A15Q8N5U1 240 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 YIPF7Q8N8F6 280 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR8K3Q8NH51 312 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ITPKCQ96DU7 683 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ULBP3Q9BZM4 244 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FKRPQ9H9S5 495 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MED11Q9P086 117 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMED7Q9Y3B3 224 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADAMTS20P59510 1910 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM265A0A087WTH1 108 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DOK2O60496 412 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADRB1P08588 477 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DCAF7P61962 342 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LPAL2Q16609 132 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MEP1BQ16820 701 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRT74Q7RTS7 529 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 METTL21AQ8WXB1 218 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC74BQ96LY2 380 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PTDSS2Q9BVG9 487 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LYRM1O43325 122 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BGLAPP02818 100 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PGCP20142 388 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GALP22466 123 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TBRG1Q3YBR2 411 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARSKQ6UWY0 536 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRSS45Q7RTY3 260 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKRD37Q7Z713 158 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SYS1Q8N2H4 156 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EXD3Q8N9H8 876 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR10AC1Q8NH08 325 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARL5BQ96KC2 179 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GUCD1Q96NT3 240 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GAREM1Q9H706 876 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SEMA5BQ9P283 1151 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCNG2Q9UJ96 466 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FLRT2O43155 660 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FADS1O60427 444 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FZD7O75084 574 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CD3GP09693 182 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TALDO1P37837 337 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PNLIPRP2P54317 469 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CBFBQ13951 182 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACKR1Q16570 336 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEP78Q5JTW2 689 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATAD3CQ5T2N8 411 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 STPG1Q5TH74 334 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLET1Q6UQ28 207 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SERPINA12Q8IW75 414 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TIGD4Q8IY51 512 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC43A2Q8N370 569 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF441Q8N8Z8 693 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR6F1Q8NGZ6 308 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SAP25Q8TEE9 199 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UPRTQ96BW1 309 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYSLTR2Q9NS75 346 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TAS2R10Q9NYW0 307 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LAMP5Q9UJQ1 280 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 H3BML4 177 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC19A2O60779 497 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EPXP11678 715 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC6A8P48029 635 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC35D3Q5M8T2 416 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF544Q6NX49 715 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR51A4Q8NGJ6 313 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF417Q8TAU3 575 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CAPSLQ8WWF8 208 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP1R14AQ96A00 147 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM185BQ9H7F4 350 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms