RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPTX1Q15818 432 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCMAPQ5T1S8 102 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 C6orf52Q5T4I8 152 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADAM5Q6NVV9 412 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 TFAP2EQ6VUC0 442 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMYD1Q8NB12 490 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 STK35Q8TDR2 534 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTDSS2Q9BVG9 487 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRIM2Q9C040 744 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 PIF1Q9H611 641 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 YY1AP1Q9H869 796 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLHL9Q9P2J3 617 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0B4J2E0 115 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1B0GX12 115 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 DHRS12A0PJE2 317 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 M0R3H8 397 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 OVOL3O00110 214 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 FMO6PO60774 539 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 DANCRP0C864 163 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 GGT1P19440 569 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 CXCR1P25024 350 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 EDNRAP25101 427 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 NTF4P34130 210 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 P2RY4P51582 365 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC35A1P78382 337 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 BSPH1Q075Z2 132 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRIP10Q15642 601 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 PAQR6Q6TCH4 344 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC103Q8IW40 242 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 MICU2Q8IYU8 434 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSD17B8Q92506 261 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC38A4Q969I6 547 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM162AQ96A26 154 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAJA3Q96EY1 480 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 SHARPINQ9H0F6 387 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 VCXQ9H320 206 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 AURKCQ9UQB9 309 aa9.55□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 H3BNX3 289 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 CXCR6O00574 342 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 LYPD3O95274 346 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 THY1P04216 161 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATP6V1B2P21281 511 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR3A2P47893 321 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDH11P55287 796 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR2B6P58173 313 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHRNB3Q05901 458 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC17A1Q14916 467 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR1Q1Q15612 314 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 TSC22D1Q15714 1073 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 STK11Q15831 433 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 FXNQ16595 210 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1orf140Q5VVS0 124 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 ULK3Q6PHR2 472 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 PIGXQ8TBF5 258 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 NEUROG1Q92886 237 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A087WUJ7 227 aa9.53□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 AQP7P3A6NL99 342 aa9.53□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPRIN2O60269 458 aa9.53□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 NDUFS7O75251 213 aa9.53□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 PNMTP11086 282 aa9.53□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCK1P16333 377 aa9.53□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 FASP25445 335 aa9.53□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 KDELR2P33947 212 aa9.53□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 DSCR9P59020 149 aa9.53□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAF11Q15544 211 aa9.53□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR7A5Q15622 319 aa9.53□□□□□ -0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAB1Q15750 504 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms