RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427230.2

NANOGP4-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP4, Length 913 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP4-201ENST00000427230 IMPG1Q17R60 797 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF404Q494X3 552 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 GXYLT1Q4G148 440 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 C6orf183Q5T699 404 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 SIGIRRQ6IA17 410 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 DLEU7Q6UYE1 221 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 C12orf54Q6X4T0 127 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 USP43Q70EL4 1123 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 ABHD13Q7L211 337 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 TMPRSS11BQ86T26 416 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 UBQLNLQ8IYU4 475 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 Q8N1X5 172 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF321PQ8N8H1 164 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 OR2M7Q8NG81 312 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 OR6F1Q8NGZ6 308 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 MCFD2Q8NI22 146 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 LINC01560Q8TB33 94 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 NDNFQ8TB73 568 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 SETD6Q8TBK2 473 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 ANKRD49Q8WVL7 239 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 PIK3R3Q92569 461 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 SGCDQ92629 289 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC38A4Q969I6 547 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 TUBGCP3Q96CW5 907 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 LGALS12Q96DT0 336 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 PITX2Q99697 317 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 TTYH2Q9BSA4 534 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 CCDC32Q9BV29 185 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 TTTY12Q9BZ98 90 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 MID1IP1Q9NPA3 183 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 ASB6Q9NWX5 421 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 ARL15Q9NXU5 204 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 SCN3BQ9NY72 215 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 FIS1Q9Y3D6 152 aa4.97□□□□□ -1.61
NANOGP4-201ENST00000427230 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 GXYLT2A0PJZ3 443 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 TUBAL3A6NHL2 446 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM220BPB1ANY3 271 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 WWP2O00308 870 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 BCKDKO14874 412 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ANKRD28O15084 1053 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 KERAO60938 352 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 GUCY1B2O75343 617 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 SEC22BO75396 215 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ATP6AP2O75787 350 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 GLSO94925 669 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ANGPTL1O95841 491 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 MT-ND2P03891 347 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 KRT8P05787 483 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 UROSP10746 265 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 TNFRSF1AP19438 455 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 M6PRP20645 277 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 HIST1H2ADP20671 130 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 AHRP35869 848 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 PIGAP37287 484 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 MAGEA2P43356 314 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 MAGEA5P43359 124 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 RPS5P46782 204 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 TRPC1P48995 793 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 DNASE1L1P49184 302 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 RGS4P49798 205 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 DEFA1P59665 94 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 DEFA3P59666 94 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 GNG2P59768 71 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 BTN3A2P78410 334 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CFHR3Q02985 330 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 LCP2Q13094 533 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 GAB1Q13480 694 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 KIAA0040Q15053 153 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CDK10Q15131 360 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 NPTX1Q15818 432 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 DUSP7Q16829 419 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 AWAT1Q58HT5 328 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM236Q5W0B7 351 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ADNP2Q6IQ32 1131 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms