RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 SCGB1D1O95968 90 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ARG2P78540 354 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 FAPQ12884 760 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 EBPQ15125 230 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 MARCH8Q5T0T0 291 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF595Q8IYB9 648 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 NAT6Q93015 286 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 OR5M11Q96RB7 305 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CAMK2AQ9UQM7 478 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 A3GALT2U3KPV4 340 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 SYT5O00445 386 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CD63P08962 238 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CPT2P23786 658 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 SHEQ5VZ18 495 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 C5orf46Q6UWT4 87 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM200AQ86VY9 491 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ENTHD1Q8IYW4 607 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 LSMEM2Q8N112 164 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC1AQ8NC01 280 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 MITD1Q8WV92 249 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 MUTYHQ9UIF7 546 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 OR52A1Q9UKL2 312 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC16A6O15403 523 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 FCGR2AP12318 317 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 TSFMP43897 325 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ESCO2Q56NI9 601 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 LPCAT3Q6P1A2 487 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CREB3L2Q70SY1 520 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC14AQ86T13 490 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 OR5D18Q8NGL1 313 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF566Q969W8 418 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 SEMA4GQ9NTN9 838 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 TAS2R16Q9NYV7 291 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 NSA2O95478 260 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP1B1P05026 303 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 IMPA1P29218 277 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 PXNP49023 591 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF684Q5T5D7 378 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 SKA3Q8IX90 412 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4N2Q8NGD1 307 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 OR10R2Q8NGX6 335 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 RHBDD1Q8TEB9 315 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ARPC5LQ9BPX5 153 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 LMAN1LQ9HAT1 526 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 PRSS38A1L453 326 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNK5O95279 499 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 HLA-FP30511 346 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF266Q14584 549 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM111BQ6SJ93 734 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 Q6ZTK2 550 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R3BQ86XI6 285 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 FRMD1Q8N878 549 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 OR1E3Q8WZA6 343 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF416Q9BWM5 594 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 OR52A5Q9H2C5 316 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 NPAP1Q9NZP6 1156 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 A6NL46 340 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 H7C1C5 153 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CA3P07451 260 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ELK1P19419 428 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 LCN6P62502 163 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC7A9P82251 487 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 IKZF1Q13422 519 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ERV3-1Q14264 604 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 AAED1Q7RTV5 226 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 SIAH3Q8IW03 269 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 L3MBTL4Q8NA19 623 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 DMBX1Q8NFW5 382 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 NMNAT3Q96T66 252 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms