RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SRPXP78539 464 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 MIDNQ504T8 468 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR13C9Q8NGT0 318 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ZFP64Q9NPA5 681 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 GNG13Q9P2W3 67 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 PLXNA3P51805 1871 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 GABRR3A8MPY1 467 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SIAH2O43255 324 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CTSHP09668 335 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 RNF224P0DH78 156 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 XCR1P46094 333 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF136P52737 540 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ZXDBP98169 803 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 UBE2V2Q15819 145 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SSX1Q16384 188 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TIGD5Q53EQ6 642 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SUSD1Q6UWL2 747 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR1E3Q8WZA6 343 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 KCNS2Q9ULS6 477 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 GTF3C1Q12789 2109 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ABCA3Q99758 1704 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 FAM74A7A6NL05 159 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SERPINA5P05154 406 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR10J1P30954 320 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CD96P40200 585 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 HSD11B2P80365 405 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 AWAT1Q58HT5 328 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 THNSL2Q86YJ6 484 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TEPSINQ96N21 525 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 GREB1Q4ZG55 1949 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 PPP6CO00743 305 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CTDSPLO15194 276 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 B3GALT2O43825 422 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ANGPTL7O43827 346 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 HPP00738 406 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 DRD2P14416 443 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OPRD1P41143 372 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CTSCP53634 463 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 RAB11AP62491 216 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 LYG2Q86SG7 212 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 UCK1Q9HA47 277 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SOCS5O75159 536 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 EPHA2P29317 976 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SELENOPP49908 381 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TEAD2Q15562 447 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 Q499Y3 187 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM201Q5SNT2 666 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 LIPNQ5VXI9 398 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR13C5Q8NGS8 318 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR4K15Q8NH41 348 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 PPTC7Q8NI37 304 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 DIRAS3O95661 229 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 POMCP01189 267 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 MPC1LP0DKB6 136 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 LIPCP11150 499 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 PSMB3P49720 205 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SLC35A1P78382 337 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 LCN10Q6JVE6 187 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF738Q8NE65 137 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 MYADMQ96S97 322 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ACER3Q9NUN7 267 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 MYOTQ9UBF9 498 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 FBXO10Q9UK96 956 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 A0A1B0GV72 72 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 M0R3H8 397 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SURF4O15260 269 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 XRCC3O43542 346 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms