RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419578.1

LINC01527-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1527, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC01527, Length 1,997 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01527-201ENST00000419578 C12orf40Q86WS4 652 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 FAM129CQ86XR2 697 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 GLB1L2Q8IW92 636 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 RAB8BQ92930 207 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 C4orf36Q96KX1 117 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 MCHR1Q99705 422 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 SEC11CQ9BY50 192 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 ENKD1Q9H0I2 346 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 OR51V1Q9H2C8 321 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 OR52D1Q9H346 318 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 C19orf12Q9NSK7 152 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 GPR160Q9UJ42 338 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 GPR34Q9UPC5 381 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 V9GY05 133 aa5.9□□□□□ -1.46
LINC01527-201ENST00000419578 DOCK6Q96HP0 2047 aa5.9□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 UPK3BL1B0FP48 263 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 J3QLW9 94 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 PLPP1O14494 284 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 FABP1P07148 127 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 ZNF19P17023 458 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 SPINK2P20155 84 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 PDHA2P29803 388 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 MPIP34949 423 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 BMI1P35226 326 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 BSGP35613 385 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 MPLP40238 635 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 DGKEP52429 567 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 HCCSP53701 268 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 CASP9P55211 416 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 RAB8AP61006 207 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 MADCAM1Q13477 382 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 ISXQ2M1V0 245 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 VWA2Q5GFL6 755 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 GLT8D1Q68CQ7 371 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 AWAT2Q6E213 333 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 TANGO2Q6ICL3 276 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 IL20RBQ6UXL0 311 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 Q6ZTK2 550 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 DPPA4Q7L190 304 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 SLC35F3Q8IY50 421 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 STOML3Q8TAV4 291 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 SMPDL3BQ92485 455 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 GHSRQ92847 366 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 AMDHD1Q96NU7 426 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 EDEM2Q9BV94 578 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 SCNM1Q9BWG6 230 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 BCL2L14Q9BZR8 327 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 C1orf198Q9H425 327 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 RNF122Q9H9V4 155 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 SPACA1Q9HBV2 294 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 CNIH4Q9P003 139 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 H7C417 338 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 K7ESF4 209 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 BHLHE40O14503 412 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 SOCS6O14544 535 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 XRCC3O43542 346 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 VEGFDO43915 354 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 CTNSO60931 367 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 CHRM4P08173 479 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 IRF1P10914 325 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 ERGP11308 486 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 CEACAM1P13688 526 aa5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LINC01527-201ENST00000419578 HLA-GP17693 338 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms