RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM72A0PK05 275 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ARPC3O15145 178 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGA10O75578 1167 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PPM1BO75688 479 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 GLCEO94923 617 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 TGM6O95932 706 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 HRGP04196 525 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 MANEAQ5SRI9 462 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01590Q5TEZ4 76 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAAF1Q8NEP3 725 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PHYHIPQ92561 330 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 C3orf49Q96BT1 292 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NOX3Q9HBY0 568 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 Q9N2J8 555 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NANSQ9NR45 359 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 MGAT4CQ9UBM8 478 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 BDP1A6H8Y1 2624 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NPIPB9F8W1W9 429 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ST6GAL1P15907 406 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK2P24941 298 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 DCTDP32321 178 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 AP3S2P59780 193 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL11BQ5VVY1 283 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0895LQ68EN5 471 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC37A2Q8TED4 501 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ASB12Q8WXK4 309 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TCF7L1Q9HCS4 588 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SERINC4A6NH21 518 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 M0R233 179 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 P2RX1P51575 399 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 FZD2Q14332 565 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 GRK1Q15835 563 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00303Q3SY05 128 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TCTE1Q5JU00 501 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 STAC2Q6ZMT1 411 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 OMA1Q96E52 524 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TAS2R10Q9NYW0 307 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF69Q9UC07 566 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNA1CQ13936 2221 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GTH9 108 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 EFCAB7A8K855 629 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAF2O60831 178 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ALDOBP05062 364 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 IFI6P09912 130 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CT45A8P0DMV1 189 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CT45A9P0DMV2 189 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 BTG2P78543 158 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CT45A2Q5DJT8 189 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 JAZF1Q86VZ6 243 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CA10Q9NS85 328 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 EMC3Q9P0I2 261 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GUH1 482 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFRSF10CO14798 259 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXS1O43638 330 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CCR4P51679 360 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CLLU1Q5K131 121 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR45BQ5MNZ6 344 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 BCORP1Q8N888 145 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 LMF1Q96S06 567 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 G6PC3Q9BUM1 346 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVK-19Q9WJR5 959 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 NAP1L6A6NFF2 107 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CTSEP14091 401 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ADRA2CP18825 462 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MAZP56270 477 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF684Q5T5D7 378 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 LIPNQ5VXI9 398 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TSSK4Q6SA08 328 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 OOSP2Q86WS3 158 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 C16orf52Q8NHV5 167 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS4Y2Q8TD47 263 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 H7C1C5 153 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 F13BP05160 661 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 GRK6P43250 576 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPS1P60891 318 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 LCN6P62502 163 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ODF4Q2M2E3 257 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ELFN2Q5R3F8 820 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SYT13Q7L8C5 426 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MEIOBQ8N635 442 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms