RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 BHLHE40O14503 412 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 VEGFDO43915 354 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MTX2O75431 263 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RBBP9O75884 186 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 KDM4BO94953 1096 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 S100A8P05109 93 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CTSLP07711 333 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MELTFP08582 738 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ELFN1P0C7U0 828 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ERGP11308 486 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CNR1P21554 472 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 HTR2AP28223 471 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 AHRP35869 848 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SSR2P43308 183 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GPR4P46093 362 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RAB13P51153 203 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 DEFA5Q01523 94 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TDGQ13569 410 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 INSL4Q14641 139 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf88Q6PI97 169 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZTK2 550 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SKA3Q8IX90 412 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 DTX3Q8N9I9 347 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MIB2Q96AX9 1013 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 HAVCR1Q96D42 359 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MVB12AQ96EY5 273 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 C16orf92Q96LL3 132 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SAMD8Q96LT4 415 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GABRG3Q99928 467 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GINS4Q9BRT9 223 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CRB3Q9BUF7 120 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MFFQ9GZY8 342 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RASL12Q9NYN1 266 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 LAMA3Q16787 3333 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0A6YYD5 115 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM202A6NGA9 273 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 K7EQS6 105 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 IMPA2O14732 288 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 YKT6O15498 198 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 KCNJ13O60928 360 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RDH16O75452 317 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ATG12O94817 140 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF432O94892 652 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SNAPINO95295 136 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PMS2P2O95744 297 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 EPPINO95925 133 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ADRB3P13945 408 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MPGP29372 298 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PYCR1P32322 319 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GPR143P51810 404 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CTSCP53634 463 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SIRPAP78324 504 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 EGR3Q06889 387 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MESP2Q0VG99 397 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZMYND11Q15326 602 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MICBQ29980 383 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TSSK4Q6SA08 328 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms