RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361311.4

CLSTN1-201, Transcript of calsyntenin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN1, Length 4,647 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1-201ENST00000361311 YIPF5Q969M3 257 aa14.74□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SCMH1Q96GD3 660 aa14.74□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.74□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 NEU3Q9UQ49 428 aa14.74□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 STRCQ7RTU9 1775 aa14.74□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 TMEM65Q6PI78 240 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 FGF18O76093 207 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 C1QCP02747 245 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 P2RX1P51575 399 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 PLA2G7Q13093 441 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 LIPNQ5VXI9 398 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 TOMM40LQ969M1 308 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 EID2BQ96D98 161 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 H7C1C5 153 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 BET1O15155 118 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 CAV2P51636 162 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 LCN6P62502 163 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 IGSF11Q5DX21 431 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 NAA40Q86UY6 237 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SYS1Q8N2H4 156 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 IL20Q9NYY1 176 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 K7EPK0 472 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SEC14L5O43304 696 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 KCNJ13O60928 360 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 AQP8O94778 261 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC34A2O95436 690 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 CD79BP40259 229 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 CSNK1G2P78368 415 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 TRILQ7L0X0 811 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 CASD1Q96PB1 797 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SGPP1Q9BX95 441 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 ICKQ9UPZ9 632 aa14.73□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 HPXP02790 462 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 F11P03951 625 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 LPLP06858 475 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 CD80P33681 288 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 LBX1P52954 281 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 RNLSQ5VYX0 342 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 Q6ZTK2 550 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC16A7O60669 478 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 PTHLHP12272 177 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 TMEM244Q5VVB8 128 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 A0A1W2PS29 197 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 CD3DP04234 171 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 THEGLP0DJG4 465 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 RD3LP0DJH9 198 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 GNRHRP30968 328 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 MAGEB1P43366 347 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 EMP2P54851 167 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 BVESQ8NE79 360 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 BPIFCQ8NFQ6 507 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SCGB1C1Q8TD33 95 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 OR5B12Q96R08 314 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 DVL2O14641 736 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 FFAR1O14842 300 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 TGM5O43548 720 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 STK17BO94768 372 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 SERPINA5P05154 406 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 OR4E1P0C645 316 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 CDK3Q00526 305 aa14.72□□□□□ -0.05
CLSTN1-201ENST00000361311 PLA1AQ53H76 456 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms