RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356924.8

ABCD4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCD4, Length 3,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-201ENST00000356924 COMMD7Q86VX2 200 aa10.08□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 LRRC17Q8N6Y2 441 aa10.08□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 ELOA3Q8NG57 546 aa10.08□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 OR51A7Q8NH64 312 aa10.08□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 RASL10BQ96S79 203 aa10.08□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 BICRALQ6AI39 1079 aa10.07□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 OR52L1Q8NGH7 329 aa10.07□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 AANATQ16613 207 aa10.07□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 SSX1Q16384 188 aa10.06□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 TIGD4Q8IY51 512 aa10.06□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 LIPHQ8WWY8 451 aa10.06□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 NLKQ9UBE8 527 aa10.06□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 TEX12Q9BXU0 123 aa10.06□□□□□ -0.8
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