RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 SELENBP1Q13228 472 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ACKR1Q16570 336 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CCDC58Q4VC31 144 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TBX5Q99593 518 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 MARCH7Q9H992 704 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CHST11Q9NPF2 352 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SDK2Q58EX2 2172 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 PRSS37A4D1T9 235 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TAF4O00268 1085 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 CDK2AP1O14519 115 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TGM1P22735 817 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 S100A5P33763 92 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ACVR1BP36896 505 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 DLSTP36957 453 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 PXKQ7Z7A4 578 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 THAP4Q8WY91 577 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 C4orf36Q96KX1 117 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 NUAK2Q9H093 628 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 A0A1W2PNV4 684 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 CENPBD1B2RD01 187 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 C11orf98E9PRG8 122 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 MS4A18H0YCH9 400 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 STMND1H3BQB6 276 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TNFRSF10AO00220 468 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 DLL1O00548 723 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 PHYHO14832 338 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ARHGEF9O43307 516 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 RAD1O60671 282 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 AHCYP23526 432 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 CLDN6P56747 220 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 FABP5Q01469 135 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 OR7A5Q15622 319 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 MS4A18Q3C1V0 323 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 STPG1Q5TH74 334 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 VASNQ6EMK4 673 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TMEM203Q969S6 136 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ARL5BQ96KC2 179 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TM9SF2Q99805 663 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 PROK2Q9HC23 129 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 HSPB2A8KAH6 182 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 J3QLW9 94 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 OGG1O15527 345 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 EFNA2O43921 213 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 CBR3O75828 277 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TNFSF15O95150 251 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TACSTD2P09758 323 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 CCL3P10147 92 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TFPIP10646 304 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 IMPDH2P12268 514 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 LIFP15018 202 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ZNF17P17021 662 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ZNF19P17023 458 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 CRABP1P29762 137 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ETV6P41212 452 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 OR12D2P58182 307 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 RUNX1T1Q06455 604 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 Q0VFX4 171 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 HSPB2Q16082 182 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 C22orf42Q6IC83 251 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TIGD4Q8IY51 512 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 OR6V1Q8N148 313 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 MFSD4AQ8N468 514 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms