RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 NCOR1O75376 2440 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 CCL3P10147 92 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 CD53P19397 219 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 GALP22466 123 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TGM4P49221 684 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 RPS15P62841 145 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 HSF2Q03933 536 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 INSL4Q14641 139 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 RPTNQ6XPR3 784 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM91Q6ZNR0 172 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 OR6V1Q8N148 313 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SCAIQ8N9R8 606 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 FNDC8Q8TC99 324 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SNX33Q8WV41 574 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 THAP4Q8WY91 577 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 FRMD6Q96NE9 622 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 SNX18Q96RF0 628 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 TPK1Q9H3S4 243 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PRG6 482 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 LIPT2A6NK58 231 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 H3BML4 177 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TAF4O00268 1085 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PLPP2O43688 288 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 GAAP10253 952 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 MAP2K6P52564 334 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 NUBP1P53384 320 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 RUNX1T1Q06455 604 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SLC3A1Q07837 685 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 Q0VFX4 171 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ZP4Q12836 540 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CHAF1BQ13112 559 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 DNASE1L3Q13609 305 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TUBA3EQ6PEY2 450 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PLCZ1Q86YW0 608 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ARMC10Q8N2F6 343 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM156Q8N614 296 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ESX1Q8N693 406 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 OR5M1Q8NGP8 315 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PELI1Q96FA3 418 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ANGPTL4Q9BY76 406 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PTGES2Q9H7Z7 377 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SH2D2AQ9NP31 389 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CHST11Q9NPF2 352 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SERINC1Q9NRX5 453 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ALKBH4Q9NXW9 302 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 GNG8Q9UK08 70 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 POLHQ9Y253 713 aa11.21□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PCSK5Q92824 1860 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SMIM30A4D0T7 59 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PRSS37A4D1T9 235 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TVP23AA6NH52 213 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 MS4A18H0YCH9 400 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CTDSP2O14595 271 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 DVL2O14641 736 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PPP5CP53041 499 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 FOXK1P85037 733 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PUDPQ08623 228 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 MELKQ14680 651 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TRAM1Q15629 374 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 TIGD4Q8IY51 512 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PAQR8Q8TEZ7 354 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 NTNG2Q96CW9 530 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 HPF1Q9NWY4 346 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 QPCTLQ9NXS2 382 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PRR32B1ATL7 298 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CASKO14936 926 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 OGG1O15527 345 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 ICAM2P13598 275 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 HLA-DOBP13765 273 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CD40LGP29965 261 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CDK5R1Q15078 307 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CSRP2Q16527 193 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 SLC22A10Q63ZE4 541 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 C3orf33Q6P1S2 294 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CDC20BQ86Y33 519 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 KDM8Q8N371 416 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 NEIL3Q8TAT5 605 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 NXPE2Q96DL1 559 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PGLYRP3Q96LB9 341 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 CEP19Q96LK0 163 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 KCNN2Q9H2S1 579 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PROK2Q9HC23 129 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-201ENST00000336128 PARD6AQ9NPB6 346 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms