RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 DKKL1Q9UK85 242 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf98E9PRG8 122 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BML4 177 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC30A4O14863 429 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC14L5O43304 696 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 AIREO43918 545 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 GABARAPO95166 117 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ATE1O95260 518 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL10O95999 233 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SBK2P0C263 348 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CD96P40200 585 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CENPAP49450 140 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A1P53007 311 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL27P61353 136 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTC1P68032 377 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTA1P68133 377 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TLE3Q04726 772 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 PUDPQ08623 228 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SELENBP1Q13228 472 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR7A5Q15622 319 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 GXYLT1Q4G148 440 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM122BQ7Z309 247 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ADCK1Q86TW2 530 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MARCH9Q86YJ5 346 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 BEST3Q8N1M1 668 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 POMGNT2Q8NAT1 580 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SDR9C7Q8NEX9 313 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10H4Q8NGA5 316 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2T4Q8NH00 348 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 POC1BQ8TC44 478 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SMPDL3BQ92485 455 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL5BQ96KC2 179 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 DDOQ99489 341 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 PIGQQ9BRB3 760 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 HCAR1Q9BXC0 346 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TXNIPQ9H3M7 391 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 PROK2Q9HC23 129 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CHST11Q9NPF2 352 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ASCL3Q9NQ33 180 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD10Q9NXR5 420 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TAS2R16Q9NYV7 291 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 LRFN1Q9P244 771 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAPPC4Q9Y296 219 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 HEATR5AQ86XA9 2040 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6C68A6NDL8 312 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM64BA6NI03 449 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 A6NIZ1 184 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 LIPT2A6NK58 231 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 GJE1A6NN92 205 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 C12orf71A8MTZ7 269 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF9O43307 516 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 EFNA2O43921 213 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ZIC3O60481 467 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINI2O75830 405 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 GLCEO94923 617 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 APOL3O95236 402 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2T7P0C7T2 308 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 LIMS3P0CW19 117 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 LIMS4P0CW20 117 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SPI1P17947 270 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC2A5P22732 501 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SRD5A2P31213 254 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ACVR1BP36896 505 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 BLVRAP53004 296 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SOX8P57073 446 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 RAP1BP61224 184 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 RAP1AP62834 184 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35A1P78382 337 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MYBPHQ13203 477 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 LSAMPQ13449 338 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TOMM20Q15388 145 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ACKR1Q16570 336 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CTF1Q16619 201 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms