RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 HDDC2Q7Z4H3 204 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 OTULINQ96BN8 352 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q96MT0 163 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 PNPLA3Q9NST1 481 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBAP1Q9NZ09 502 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR52Q9Y2T5 361 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 A6NIZ1 184 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC2A10O95528 541 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACVR2AP27037 513 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAP1BP61224 184 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAP1AP62834 184 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 POU4F3Q15319 338 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.519e-6■■■■■ 27.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM205BPQ63HN1 556 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR9K2Q8NGE7 335 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5M9Q8NGP3 310 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZPLD1Q8TCW7 415 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 DSPP15924 2871 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 M0R3G1 203 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYTIPO60759 359 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK5R2Q13319 367 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 MELKQ14680 651 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCEMP1Q8IX19 187 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNIH3Q8TBE1 160 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 FN3KQ9H479 309 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASF1BQ9NVP2 202 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF175Q9Y473 711 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATMQ13315 3056 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPRP12270 2363 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLCA1A8K7I4 914 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCGR2AP12318 317 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC17A1Q14916 467 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 P4HA3Q7Z4N8 544 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADCK1Q86TW2 530 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF786Q8N393 782 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM26EQ8N5C1 309 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDR9C7Q8NEX9 313 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 FNDC9Q8TBE3 224 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRR1Q96L50 414 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 MED29Q9NX70 200 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL9Q9P2J3 617 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 AASSQ9UDR5 926 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZZEF1O43149 2961 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJC13O75165 2243 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A20A6NK97 555 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF726A6NNF4 738 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 AHRRA9YTQ3 701 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGEF9O43307 516 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 RENP00797 406 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 BIDP55957 195 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGADQ13349 1161 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEDAGQ5VYS4 303 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 LEG1Q6P5S2 330 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 CREB3L2Q70SY1 520 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC37A3Q8NCC5 494 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASB10Q8WXI3 467 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 NMNAT3Q96T66 252 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLX1AQ9BQ83 275 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNTNA6NMZ2 147 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNHIT1O43257 154 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABOP16442 354 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 TDGF1P3P51864 188 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLDN17P56750 224 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFNB1P98172 346 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRMP1Q14194 572 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF585AQ6P3V2 769 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 GFRALQ6UXV0 394 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPOQ8IVL8 374 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYB561A3Q8NBI2 242 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF519Q8TB69 540 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF128Q8TEB7 428 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBLIM1Q8WUP2 373 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 TXNDC15Q96J42 360 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIB1Q96RU8 372 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 EMC3Q9P0I2 261 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPOP07202 933 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 GABRB1P18505 474 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEKQ02763 1124 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 OCLNQ16625 522 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 MESTQ5EB52 335 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 C6orf141Q5SZD1 244 aa24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms