RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297537.4

GBX1-201, Transcript of gastrulation brain homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GBX1, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1-201ENST00000297537 PRKCDQ05655 676 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 STK11Q15831 433 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 C9orf135Q5VTT2 229 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 TBPL2Q6SJ96 375 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 WDR31Q8NA23 367 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 SLC7A13Q8TCU3 470 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 DHRS1Q96LJ7 313 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 MUC13Q9H3R2 512 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 SLC25A15Q9Y619 301 aa20.55■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 AKAP6Q13023 2319 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ZNF587BE7ETH6 402 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 hCG_2039718K7EN88 272 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 RNF13O43567 381 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 KRT33AO76009 404 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 IFI30P13284 250 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 IFNGR1P15260 489 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ATP6V1B2P21281 511 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 NR1H2P55055 460 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 PPA1Q15181 289 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 NRMQ8IXM6 262 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 C20orf196Q8IYI0 205 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 C17orf78Q8N4C9 275 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 MUCL1Q96DR8 90 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 PLPPR2Q96GM1 343 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 TMEM204Q9BSN7 226 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 IL1RAPQ9NPH3 570 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 V9GYQ6 96 aa20.54■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 AKAP9Q99996 3911 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 TCRBV5S2A0A599 114 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 PDE5AO76074 875 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 DIRAS1O95057 198 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 H1F0P07305 194 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ITGA2P17301 1181 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 MAKP20794 623 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 FHL1Q13642 323 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 MTX3Q5HYI7 312 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 PHYHD1Q5SRE7 291 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 NCMAPQ5T1S8 102 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 LCN8Q6JVE9 175 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 CYP2R1Q6VVX0 501 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 SLC35D2Q76EJ3 337 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 CDH24Q86UP0 819 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 OR6X1Q8NH79 312 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 PIP5K1AQ99755 562 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 FUZQ9BT04 418 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 NGBQ9NPG2 151 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 SLC17A5Q9NRA2 495 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 HIF3AQ9Y2N7 669 aa20.53■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 AQP2P41181 271 aa20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ZNF730Q6ZMV8 503 aa20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 GPR137CQ8N3F9 429 aa20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 OR1K1Q8NGR3 316 aa20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 OR52N5Q8NH56 324 aa20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 GPR35Q9HC97 309 aa20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 NPAP1Q9NZP6 1156 aa20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa20.52■□□□□ 0.88
GBX1-201ENST00000297537 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 DPRXA6NFQ7 191 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 ZNF726A6NNF4 738 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 SERPINI2O75830 405 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 BIDP55957 195 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 BNIP1Q12981 228 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 CAMK2DQ13557 499 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 LAPTM4AQ15012 233 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 HMBOX1Q6NT76 420 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 PODNL1Q6PEZ8 512 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 DHFR2Q86XF0 187 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 MOSPD2Q8NHP6 518 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 ASB9Q96DX5 294 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 THTPAQ9BU02 230 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 NELFAQ9H3P2 528 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 CRLF2Q9HC73 371 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 OTOGQ6ZRI0 2925 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 CREBBPQ92793 2442 aa20.51■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa20.5■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 A0A1W2PR80 420 aa20.5■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 ACOT8O14734 319 aa20.5■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 F13BP05160 661 aa20.5■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 FABP3P05413 133 aa20.5■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GBX1-201ENST00000297537 CARD17Q5XLA6 110 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms