RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.71□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 AIM2O14862 343 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 NCR1O76036 304 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 NGFP01138 241 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHMP01871 453 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMP1P11279 417 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF35P13682 527 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CPT2P23786 658 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEB1P43366 347 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CCT5P48643 541 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJB13P59910 316 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB1AP62820 205 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 RBBP4Q09028 425 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF154Q13106 437 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF519Q8TB69 540 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 STK35Q8TDR2 534 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL17Q92583 94 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 COQ8BQ96D53 544 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 OXGR1Q96P68 337 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CITED1Q99966 193 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51I1Q9H343 314 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 NELFAQ9H3P2 528 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 NANOGQ9H9S0 305 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH20Q9HBT6 801 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF726A6NNF4 738 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FRS3O43559 492 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC14L2O76054 403 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFA7O95182 113 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-HP01893 362 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LCKP06239 509 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00032P0C843 101 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MYZAPP0CAP1 466 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 OR12D1P0DN82 309 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 UQCRC2P22695 453 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 OMGP23515 440 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CRHR1P34998 444 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 GIPRP48546 466 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 HBA1P69905 142 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PLP2Q04941 152 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGFQ07326 219 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf54Q08AI8 447 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 EPS8Q12929 822 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK14Q16539 360 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FXNQ16595 210 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ESCO2Q56NI9 601 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TTMPQ5BVD1 217 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf74Q6P047 294 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PARP8Q8N3A8 854 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CADM2Q8N3J6 435 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM86BQ8N661 226 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.69□□□□□ -1.34
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