RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 CENPOQ9BU64 300 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 H7C1C5 153 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC30A4O14863 429 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF13O43567 381 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 LALBAP00709 142 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TFPIP10646 304 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP6V1E1P36543 226 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 WNT4P56705 351 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR85P60893 370 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 LCN6P62502 163 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ACKR1Q16570 336 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 EMC4Q5J8M3 183 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF519Q8TB69 540 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ASPNQ9BXN1 380 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 LRFN1Q9P244 771 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A087WZY1 265 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PNR3 127 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CBR3O75828 277 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TFP02787 698 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 VBP1P61758 197 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NCS1P62166 190 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GGTLC2Q14390 218 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SCAIQ8N9R8 606 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 C5orf34Q96MH7 638 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NKX2-8O15522 239 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 AKR7A3O95154 331 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 WDPCPO95876 746 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 DIO1P49895 249 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 P2RY4P51582 365 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PUDPQ08623 228 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXO1Q12778 655 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SELENBP1Q13228 472 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6V1Q8N148 313 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ACBD7Q8N6N7 88 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TBX5Q99593 518 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR51E2Q9H255 320 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR70Q9NW82 654 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TEKT2Q9UIF3 430 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2M5A3KFT3 312 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CCRL2O00421 344 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHMP01871 453 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SFTPDP35247 375 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A1P53007 311 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 HCCSP53701 268 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL27P61353 136 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NHLH1Q02575 133 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RUNX1T1Q06455 604 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZP4Q12836 540 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RTP5Q14D33 572 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PHC2Q8IXK0 858 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NDNFQ8TB73 568 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SMPDL3BQ92485 455 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NXPE2Q96DL1 559 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ALKBH4Q9NXW9 302 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRTM2O43300 516 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 KLK2P20151 261 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PYCR1P32322 319 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF85Q03923 595 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PON3Q15166 354 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms