RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CUTCQ9NTM9 273 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CD207Q9UJ71 328 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PLXNA2O75051 1894 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TVP23AA6NH52 213 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 A6NL46 340 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SULT1C2O00338 296 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GPR171O14626 319 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 RAB3DO95716 219 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 IL33O95760 270 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MYOGP15173 224 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CD34P28906 385 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 DOC2BQ14184 412 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 OR52I2Q8NH67 350 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 COQ8AQ8NI60 647 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 NRTNQ99748 197 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 OR2AT4A6NND4 320 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF726A6NNF4 738 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ZNF208O43345 1280 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ATF1P18846 271 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PTH2RP49190 550 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 VEGFCP49767 419 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 POU4F3Q15319 338 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 FRMD1Q8N878 549 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PPA2Q9H2U2 334 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 KIF25Q9UIL4 384 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 C7orf66A4D0T2 115 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 OR6C76A6NM76 312 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CYR61O00622 381 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 M6PRP20645 277 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R20P59543 309 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SPICQ8N5J4 248 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CCL4L1Q8NHW4 92 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 ELP5Q8TE02 316 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PTP4A1Q93096 173 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PELI1Q96FA3 418 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 Q96M85 177 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R5Q9NYW4 299 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PRELID1Q9Y255 219 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SCN5AQ14524 2016 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 A0A0D9SG52 128 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CBX7O95931 251 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PDGFAP04085 211 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 AMY2AP04746 511 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 HEXBP07686 556 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 GLULP15104 373 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 EVI2BP34910 448 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 PBX2P40425 430 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 CLRN1P58418 232 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 TEX261Q6UWH6 196 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 BEST4Q8NFU0 473 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 NKD1Q969G9 470 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 OR1F2PQ96R84 312 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 U3KQ87 197 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-201ENST00000264345 FRG2CA6NGY1 282 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 K7EQS6 105 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PSMD9O00233 223 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PMS2P2O95744 297 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 EPPINO95925 133 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ARL6IP1Q15041 203 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 NSDHLQ15738 373 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 GRK1Q15835 563 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 GSG1Q2KHT4 349 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 LIPNQ5VXI9 398 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 OR13C5Q8NGS8 318 aa8.09□□□□□ -1.12
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