RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ZNF69Q9UC07 566 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 SPATA2Q9UM82 520 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 FKBP7Q9Y680 259 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 A0A087WUJ7 227 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 A0A087WV62 115 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 GPR171O14626 319 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 KCNAB3O43448 404 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ALX3O95076 343 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 DIO1P49895 249 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 GSG1Q2KHT4 349 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 LINC00303Q3SY05 128 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 MESTQ5EB52 335 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 FAM209AQ5JX71 171 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 POMT2Q9UKY4 750 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 SATB2Q9UPW6 733 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ALDOBP05062 364 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 FMODQ06828 376 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 TMEM106AQ96A25 262 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 MAP6Q96JE9 813 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 CHST6Q9GZX3 395 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.88□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 IFITM5A6NNB3 132 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 UTS2O95399 124 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 DHFRP00374 187 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 PNPP00491 289 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 CLPSP04118 112 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 RLN1P04808 185 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 CCKBRP32239 447 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 GRK6P43250 576 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 FNTBP49356 437 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 NDUFA5Q16718 116 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 NSMAFQ92636 917 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 FOXQ1Q9C009 403 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ZNF879B4DU55 563 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 MASP2O00187 686 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 OR7A10O76100 309 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 SPARCP09486 303 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 OR2T7P0C7T2 308 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 OR3A3P47888 321 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ZNF117Q03924 483 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 RNF144BQ7Z419 303 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 FTMTQ8N4E7 242 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 OR2T27Q8NH04 317 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 OR56B4Q8NH76 319 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 SPACA5Q96QH8 159 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.87□□□□□ -1.15
GINS1-201ENST00000262460 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms