RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 OR1F2PQ96R84 312 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 LYRM4Q9HD34 91 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 POLE3Q9NRF9 147 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 SNRPGP15A8MWD9 76 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 C10orf142B7Z368 130 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 TNFP01375 233 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 RAB40ALP0C0E4 278 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 RABIFP47224 123 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 STX4Q12846 297 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 CBFBQ13951 182 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 ZNF684Q5T5D7 378 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 OR4N2Q8NGD1 307 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 RAB40AQ8WXH6 277 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 CTHRC1Q96CG8 243 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 RASD2Q96D21 266 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa22.52■■□□□ 1.2
LMO2-201ENST00000257818 A0A1B0GVT2 93 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 OR6C74A6NCV1 312 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 ACOT7O00154 380 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 CBX7O95931 251 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 VSIG10L2P0DP72 767 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 ADRA2CP18825 462 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 RPL4P36578 427 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 TAS2R20P59543 309 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 STAC2Q6ZMT1 411 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 ABHD13Q7L211 337 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 RLN3Q8WXF3 142 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 RIT1Q92963 219 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 URADA6NGE7 173 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 FAM171A2A8MVW0 826 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 CALCBP10092 127 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 BTN1A1Q13410 526 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 SLC35F3Q8IY50 421 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 OR52R1Q8NGF1 315 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 MIB2Q96AX9 1013 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 SGTBQ96EQ0 304 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 ARPC5LQ9BPX5 153 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 MED9Q9NWA0 146 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 C4orf47A7E2U8 309 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 POM121CA8CG34 1229 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 TNFSF14O43557 240 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 SRFP11831 508 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 ART1P52961 327 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 PLA2G7Q13093 441 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 IL10RAQ13651 578 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 C2orf68Q2NKX9 166 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 ALKAL2Q6UX46 152 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 OR6M1Q8NGM8 313 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 SLC22A18Q96BI1 424 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 SEMA4CQ9C0C4 833 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 PPM1BO75688 479 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 IFNA16P05015 189 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 PSG6Q00889 435 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 KIR2DS3Q14952 304 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 SLC35D3Q5M8T2 416 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 LINC01590Q5TEZ4 76 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 ULK3Q6PHR2 472 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 FIGLAQ6QHK4 219 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 COQ8AQ8NI60 647 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 SHARPINQ9H0F6 387 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 CA14Q9ULX7 337 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 B3GALNT1O75752 331 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 HIST1H2ABP04908 130 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 LPLP06858 475 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 MNDAP41218 407 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 ERVK-25P63136 954 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 DNM1P46Q6ZS02 220 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 CAMKVQ8NCB2 501 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 DNAAF1Q8NEP3 725 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 GPBAR1Q8TDU6 330 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 HIST1H2ACQ93077 130 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 CTNSO60931 367 aa22.48■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 SIX6O95475 246 aa22.48■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 IGLV3-19P01714 112 aa22.48■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 PROS1P07225 676 aa22.48■■□□□ 1.19
LMO2-201ENST00000257818 THEGLP0DJG4 465 aa22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms