RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 ALDH3A2P51648 485 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 PER3P56645 1201 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 PRPS1P60891 318 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 PPP2R2BQ00005 443 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 FHL1Q13642 323 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 DAG1Q14118 895 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 ALG10Q5BKT4 473 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 KIF18BQ86Y91 864 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 UEVLDQ8IX04 471 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 SLC43A2Q8N370 569 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 SAMD8Q96LT4 415 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 DOCK7Q96N67 2140 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 OXGR1Q96P68 337 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 TM9SF2Q99805 663 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 SLC29A1Q99808 456 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 OR52D1Q9H346 318 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 RASD1Q9Y272 281 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.59□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 MED12LQ86YW9 2145 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SPTA1P02549 2419 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PRG6 482 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF716A6NP11 495 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 MCIDASD6RGH6 385 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CCL21O00585 134 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 LCE2BO14633 110 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PTP4A3O75365 173 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RCBTB2O95199 551 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IL2RAP01589 272 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ALPLP05186 524 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 STSP08842 583 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TSPAN19P0C672 248 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GLI4P10075 376 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OSMP13725 252 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-DOBP13765 273 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF43P17038 809 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 POU1F1P28069 291 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 FXYD6P3P58550 94 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CTXN1P60606 82 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PMPCAQ10713 525 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZP4Q12836 540 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 COX10Q12887 443 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC17A1Q14916 467 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RFX4Q33E94 735 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC36A3Q495N2 470 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OR2A2Q6IF42 318 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PXKQ7Z7A4 578 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NRG4Q8WWG1 115 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 HPS1Q92902 700 aa7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms