RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC6A12P48065 614 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 PEA15Q15121 130 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 Q499Y3 187 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 UBE2NLQ5JXB2 153 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 C3orf33Q6P1S2 294 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF566Q969W8 418 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 SSX3Q99909 188 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF160Q9HCG1 818 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 NDUFB11Q9NX14 153 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 SCN1AP35498 2009 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLX4Q8IY92 1834 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 KLK8O60259 260 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 WDPCPO95876 746 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 SRMP19623 302 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 RAB3AP20336 220 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACY1Q03154 408 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 KIR2DS3Q14952 304 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 EBPQ15125 230 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM244Q5VVB8 128 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 LIPNQ5VXI9 398 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC2A12Q8TD20 617 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 TSSK2Q96PF2 358 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR5B12Q96R08 314 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACOXLQ9NUZ1 547 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 SDHAF2Q9NX18 166 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 CBLCQ9ULV8 474 aa12.91□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 UNC13CQ8NB66 2214 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 GMDSO60547 372 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 LGI1O95970 557 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 DBHP09172 617 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 S100PP25815 95 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 TPMTP51580 245 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 PLP2Q04941 152 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 CD276Q5ZPR3 534 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 UEVLDQ8IX04 471 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR5D14Q8NGL3 314 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 ST8SIA4Q92187 359 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 NRSN2Q9GZP1 204 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 EMC7Q9NPA0 242 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF175Q9Y473 711 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 PIAS3Q9Y6X2 628 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR2T1O43869 369 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 PEX11BO96011 259 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 BCL6P41182 706 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 MFSD12Q6NUT3 480 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 FRZBQ92765 325 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 A0A1W2PR48 441 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 CIB4A0PJX0 185 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 GGT3PA6NGU5 568 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 TP53I11O14683 189 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 DPM1O60762 260 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 MSL3P1P0C860 447 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 TACR3P29371 465 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 FASLGP48023 281 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 HTRA3P83110 453 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 BATFQ16520 125 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 SULF2Q8IWU5 870 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 MFSD4AQ8N468 514 aa12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RPS6KC1-208ENST00000614059 RAF1P04049 648 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC2A1P11166 492 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 PTHLHP12272 177 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 C2CD4CQ8TF44 421 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZFPM2Q8WW38 1151 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 NINJ1Q92982 152 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 PTDSS2Q9BVG9 487 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 UBQLN4Q9NRR5 601 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 CPNE7Q9UBL6 633 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 CKAP5Q14008 2032 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC5A10A0PJK1 596 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 OIP5O43482 229 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 CA3P07451 260 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 HACD4Q5VWC8 232 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADAM5Q6NVV9 412 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC48A1Q6P1K1 146 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM88Q6PEY1 159 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 Q6ZTK2 550 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 AVL9Q8NBF6 648 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZBTB44Q8NCP5 570 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 EMC9Q9Y3B6 208 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 SYT5O00445 386 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 CHRM4P08173 479 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRAPPC2P0DI81 140 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRAPPC2BP0DI82 140 aa12.89□□□□□ -0.35
RPS6KC1-208ENST00000614059 LIM2P55344 173 aa12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms