RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	OR1C1	Q15619	314 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SGCB	Q16585	318 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SLC6A19	Q695T7	634 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	BORA	Q6PGQ7	559 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	CPO	Q8IVL8	374 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	OR2M7	Q8NG81	312 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	OR5J2	Q8NH18	312 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	FAR1	Q8WVX9	515 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	MUL1	Q969V5	352 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	RASD2	Q96D21	266 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916		Q96M85	177 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916		Q96MT0	163 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	COPS4	Q9BT78	406 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	RNF32	Q9H0A6	362 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	POLH	Q9Y253	713 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	DOCK7	Q96N67	2140 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PVT1-222	ENST00000613916	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SVIL	O95425	2214 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	OR2M5	A3KFT3	312 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	OR5H15	A6NDH6	313 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916		A6NL46	340 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916		H3BML4	177 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	PLPP3	O14495	311 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	IDH3B	O43837	385 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	OR2T1	O43869	369 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	CEACAM4	O75871	244 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	INMT	O95050	263 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	OPN1LW	P04000	364 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	F13B	P05160	661 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SP1	P08047	785 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	TFPI	P10646	304 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	CLU	P10909	449 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SRD5A2	P31213	254 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	P2RY4	P51582	365 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	CTXN1	P60606	82 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ZP4	Q12836	540 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	MYBPH	Q13203	477 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SELENBP1	Q13228	472 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	RAB39A	Q14964	217 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	NEDD8	Q15843	81 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ALG10	Q5BKT4	473 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	NIPAL3	Q6P499	406 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SULF2	Q8IWU5	870 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	OR4K13	Q8NH42	304 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	HAS2	Q92819	552 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	MYDGF	Q969H8	173 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	DDIT4L	Q96D03	193 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	LGALS12	Q96DT0	336 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	AGAP4	Q96P64	663 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF649	Q9BS31	505 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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