RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608107.1

ITGB5-211, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-211ENST00000608107 CTXN1P60606 82 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 PUDPQ08623 228 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 PMPCAQ10713 525 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 ZP4Q12836 540 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 FOXF2Q12947 444 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 SLC17A1Q14916 467 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 NAXEQ8NCW5 288 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 OR9K2Q8NGE7 335 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 PRR7Q8TB68 274 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 WNT2BQ93097 391 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 EME1Q96AY2 570 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 C9orf16Q9BUW7 83 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 OR52D1Q9H346 318 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 RNF122Q9H9V4 155 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 USE1Q9NZ43 259 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 RASD1Q9Y272 281 aa9.13□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 A0A1W2PNV4 684 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 CCL21O00585 134 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 DLGAP1O14490 977 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 NDUFB2O95178 105 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 PPP1R3DO95685 299 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 OSMP13725 252 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 IFNGR1P15260 489 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 POU1F1P28069 291 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 PTGER4P35408 488 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 ERVK-25P63136 954 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 SIRPAP78324 504 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 MELKQ14680 651 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 RFX4Q33E94 735 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 SLC36A3Q495N2 470 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 ALG10Q5BKT4 473 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 SMARCD3Q6STE5 483 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 CREB3L2Q70SY1 520 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 SLC43A2Q8N370 569 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 IQCF1Q8N6M8 205 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 FANK1Q8TC84 345 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 EMC6Q9BV81 110 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 TSSK6Q9BXA6 273 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 INIPQ9NRY2 104 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 KRT84Q9NSB2 600 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 MED29Q9NX70 200 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 IL20Q9NYY1 176 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 POFUT2Q9Y2G5 429 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 MEMO1Q9Y316 297 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 E9PLN8 166 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 IMPA2O14732 288 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 RCBTB2O95199 551 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 SNAP29O95721 258 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF43P17038 809 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 GSTM3P21266 225 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 AGTR1P30556 359 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 RPL4P36578 427 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 ALDH3A2P51648 485 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 SLC16A1P53985 500 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 CASP6P55212 293 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 PER3P56645 1201 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 CLDN17P56750 224 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 RUNX1T1Q06455 604 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGB5-211ENST00000608107 LGALS3BPQ08380 585 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms