RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HLA-HP01893 362 aa13.13□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF35P13682 527 aa13.13□□□□□ -0.31
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 P2RY4P51582 365 aa13.13□□□□□ -0.31
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PIGFQ07326 219 aa13.13□□□□□ -0.31
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RAB1CQ92928 201 aa13.13□□□□□ -0.31
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDM8Q8N371 416 aa13.12□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CADM2Q8N3J6 435 aa13.12□□□□□ -0.31
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM233B4DJY2 109 aa13.1□□□□□ -0.31
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UQCRC2P22695 453 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CASQ1P31415 396 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GIPRP48546 466 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCT5P48643 541 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC9A3R2Q15599 337 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FBLN7Q53RD9 439 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WBP2NLQ6ICG8 309 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BRICD5Q6PL45 260 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF813Q6ZN06 617 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP51Q70EK9 711 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RIMKLAQ8IXN7 391 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CNPY4Q8N129 248 aa13.1□□□□□ -0.31
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