RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597023.1

PPFIA4-208, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 4, human

TSL 4

Gene PPFIA4, Length 496 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPFIA4-208	ENST00000597023	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NUDT6	P53370	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NPTX1	Q15818	432 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	TXNDC15	Q96J42	360 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	SH3GL1	Q99961	368 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NELFA	Q9H3P2	528 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023		M0R3G1	203 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	FZD7	O75084	574 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	RBBP4	Q09028	425 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	PMS2P3	Q13401	168 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ETFDH	Q16134	617 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	UEVLD	Q8IX04	471 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	TAMM41	Q96BW9	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	OR2M2	Q96R28	347 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ASPN	Q9BXN1	380 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	GPR35	Q9HC97	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	MED29	Q9NX70	200 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	USP22	Q9UPT9	525 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	RCE1	Q9Y256	329 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	C11orf98	E9PRG8	122 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	LY6H	O94772	140 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NPPA	P01160	153 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	THY1	P04216	161 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CELA3B	P08861	270 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CD247	P20963	164 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	AHCY	P23526	432 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	GZMM	P51124	257 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	PPP2R2B	Q00005	443 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	RAB35	Q15286	201 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NRF1	Q16656	503 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	RABL3	Q5HYI8	236 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CGB2	Q6NT52	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	EPYC	Q99645	322 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NANOG	Q9H9S0	305 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CRLF2	Q9HC73	371 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	SLC35F4	A4IF30	521 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	GPRIN2	O60269	458 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CECR9	P0C854	216 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CALCR	P30988	508 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	PCGF2	P35227	344 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CAPZA2	P47755	286 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ARFIP2	P53365	341 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	MAPRE2	Q15555	327 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	TMEM123	Q8N131	208 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF525	Q8N782	197 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPFIA4-208	ENST00000597023	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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