RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 OR10D3Q8NH80 312 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 PFN4Q8NHR9 129 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 TAAR8Q969N4 342 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PNR3 127 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 FIGNL2A6NMB9 653 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 G3V2T6 193 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR1O75083 606 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 OR7A10O76100 309 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAP00813 363 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 BGLAPP02818 100 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 IMPDH2P12268 514 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ANXA8P13928 327 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 OMPP47874 163 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 CLDN15P56746 228 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 TBPL2Q6SJ96 375 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 C10orf53Q8N6V4 93 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 OR5M9Q8NGP3 310 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 OSTF1Q92882 214 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ASPNQ9BXN1 380 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 DGCR6LQ9BY27 220 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 NANSQ9NR45 359 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF175Q9Y473 711 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM215AQ9Y5M1 114 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 INAFM1C9JVW0 142 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF9O43307 516 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 PIP5K1CO60331 668 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 OPN1LWP04000 364 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 FPR3P25089 353 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 UQCRC1P31930 480 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2B6P58173 313 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 SRYQ05066 204 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 OR7A5Q15622 319 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 SGCBQ16585 318 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXW10Q5XX13 1052 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF585AQ6P3V2 769 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 PGBD2Q6P3X8 592 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 P3H2Q8IVL5 708 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 UCN2Q96RP3 112 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 C8orf4Q9NR00 106 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 C20orf141Q9NUB4 165 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 OAZ3Q9UMX2 235 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 EFCAB9A8MZ26 197 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 KLF4O43474 513 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 CXCL13O43927 109 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 SYNGR4O95473 234 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 CH25HO95992 272 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST1H2ABP04908 130 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 FCGR2AP12318 317 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 GSTM3P21266 225 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF11Q15544 211 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 RTL6Q6ICC9 239 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 PAQR6Q6TCH4 344 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ZER1Q7Z7L7 766 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 AQP11Q8NBQ7 271 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ICA1LQ8NDH6 482 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST1H2ACQ93077 130 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 C9orf16Q9BUW7 83 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 NDEL1Q9GZM8 345 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF556Q9HAH1 456 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ASAH2BP0C7U1 165 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 SAGP10523 405 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CD53P19397 219 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 FUT1P19526 365 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 PTNP21246 168 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 ENPP1P22413 925 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CBLP22681 906 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 GSSP48637 474 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC34A1Q06495 639 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 COX10Q12887 443 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPAN31Q12999 210 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CD300LDQ6UXZ3 194 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 OR9Q2Q8NGE9 314 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 OR5J2Q8NH18 312 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC25A36Q96CQ1 311 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 TUBA1CQ9BQE3 449 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 H0YC42 278 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 H7C1Q1 480 aa21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.4 ms