RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 FZD7O75084 574 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 DAG1Q14118 895 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 MSMPQ1L6U9 139 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PHYHD1Q5SRE7 291 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 RINLQ6ZS11 566 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS33AQ96AX1 596 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2M2Q96R28 347 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 TPT1P8Q9HAU6 139 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF232Q9UNY5 417 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 M0R082 166 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPZA2P47755 286 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 IL1RL1Q01638 556 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM123Q8N131 208 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF417Q8TAU3 575 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0G2JPF8 293 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ANP32DO95626 131 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 IL6P05231 212 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC18P0CG32 403 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 C1DQ13901 141 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF311Q5JNZ3 666 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf89Q6UWU4 347 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 TAAR8Q969N4 342 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMC7Q9H6L4 198 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 USP22Q9UPT9 525 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 IFT52Q9Y366 437 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 AIM2O14862 343 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT7P0C024 238 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3C3Q8NEB9 887 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A3Q96HJ5 214 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CMAHPQ9Y471 501 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 M0R3G1 203 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 HDAC3O15379 428 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A3O75751 556 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-HP01893 362 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CBLP22681 906 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 NR4A1P22736 598 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 GRPRP30550 384 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ELFN2Q5R3F8 820 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM69AQ5T7M9 428 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC36Q8IYA8 594 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 IL17RDQ8NFM7 739 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB9Q96C00 473 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GNT2Q9NY97 397 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 VENTXO95231 258 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 IDO1P14902 403 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CARD17Q5XLA6 110 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT2A3Q6UWM9 527 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CARM1Q86X55 608 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 MREGQ8N565 214 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 MAL2Q969L2 176 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35B4Q969S0 331 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 METRNQ9UJH8 293 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM247A6NEH6 219 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 B4DSR2 109 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 M0R233 179 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 DYNC1I1O14576 645 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNGR3O43761 229 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2T1O43869 369 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 HPRP00739 348 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 KITP10721 976 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DOBP13765 273 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR2AP28223 471 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 RUNX1T1Q06455 604 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 NXNQ6DKJ4 435 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf54Q6X4T0 127 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 COMTD1Q86VU5 262 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 C20orf196Q8IYI0 205 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC38A4Q969I6 547 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ITCHQ96J02 903 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF75AQ96N20 296 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 OCEL1Q9H607 264 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 RMND5AQ9H871 391 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf10Q9HB07 376 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL2L10Q9HD36 194 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL14Q9P2G3 628 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa22.07■■□□□ 1.12
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