RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 HTRA1Q92743 480 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OSTF1Q92882 214 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RASD2Q96D21 266 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NRBF2Q96F24 287 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TXNDC15Q96J42 360 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 Q96M85 177 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR137Q96N19 417 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXN4Q96NZ1 517 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIB1Q96RU8 372 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PSD2Q9BQI7 771 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 EMC6Q9BV81 110 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TAPBPLQ9BX59 468 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 DGCR6LQ9BY27 220 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 MED20Q9H944 212 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF556Q9HAH1 456 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CHST11Q9NPF2 352 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NANSQ9NR45 359 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 MED29Q9NX70 200 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 QPCTLQ9NXS2 382 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TAS2R5Q9NYW4 299 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 USE1Q9NZ43 259 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 B3GAT1Q9P2W7 334 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 AP4B1Q9Y6B7 739 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ACACAQ13085 2346 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ARRDC5A6NEK1 342 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM183AA6NL82 134 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 AQP7O14520 342 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF13O43567 381 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKYO43930 277 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GPANK1O95872 356 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ACTL6AO96019 429 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CRYABP02511 175 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CLUP10909 449 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 UQCRC1P31930 480 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PTGS2P35354 604 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GCKP35557 465 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 IFNGR2P38484 337 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CLDN17P56750 224 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SIRPAP78324 504 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 MYBPC1Q00872 1141 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RUNX1T1Q06455 604 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 NPRL3Q12980 569 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 IGFBP7Q16270 282 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RFX4Q33E94 735 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBED5Q49AG3 693 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ALG10Q5BKT4 473 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RTL6Q6ICC9 239 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RPTNQ6XPR3 784 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 B3GLCTQ6Y288 498 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GPAT4Q86UL3 456 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK20Q8IZL9 346 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 CYB561A3Q8NBI2 242 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5J2Q8NH18 312 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4K13Q8NH42 304 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX47Q8TBZ9 253 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 MIB2Q96AX9 1013 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPAN32Q96QS1 320 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RHNO1Q9BSD3 238 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ADI1Q9BV57 179 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 IFT27Q9BW83 186 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 HCAR1Q9BXC0 346 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 ASPNQ9BXN1 380 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 POTEKPQ9BYX7 375 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 FKRPQ9H9S5 495 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 HHATLQ9HCP6 504 aa5.37□□□□□ -1.55
CAPNS1-208ENST00000589162 RASSF1Q9NS23 344 aa5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms