RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570051.5

RNPS1-226, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-226ENST00000570051 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa18.19■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 FAM86B1Q8N7N1 296 aa18.19■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 PFN4Q8NHR9 129 aa18.19■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 HS3ST6Q96QI5 342 aa18.19■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa18.19■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 NANSQ9NR45 359 aa18.19■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa18.19■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF229Q9UJW7 825 aa18.19■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 OTOGQ6ZRI0 2925 aa18.19■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ALPK2Q86TB3 2170 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 OR6C65A6NJZ3 312 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 PRSS23O95084 383 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 IFNA8P32881 189 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 LGALS3BPQ08380 585 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 STK11Q15831 433 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 TIMM23BQ5SRD1 257 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 C9orf135Q5VTT2 229 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 NHLRC1Q6VVB1 395 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 UEVLDQ8IX04 471 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 LRRC17Q8N6Y2 441 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 HS6ST2Q96MM7 605 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 LIME1Q9H400 295 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 C20orf141Q9NUB4 165 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 RHCGQ9UBD6 479 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 NOX1Q9Y5S8 564 aa18.18■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ROS1P08922 2347 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 CIB4A0PJX0 185 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 OR5H1A6NKK0 313 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ARPC2O15144 300 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ASAH2BP0C7U1 165 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ADORA3P0DMS8 318 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 MPGP29372 298 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 GABRA6Q16445 453 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ALKBH2Q6NS38 261 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 RINLQ6ZS11 566 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 PXKQ7Z7A4 578 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 P2RY8Q86VZ1 359 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 MUS81Q96NY9 551 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 FNDC11Q9BVV2 318 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 LINC00470Q9BZP3 86 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 MED31Q9Y3C7 131 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ENPP4Q9Y6X5 453 aa18.17■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 UPK3AO75631 287 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 KRT33AO76009 404 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 UMPSP11172 480 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 AHCYP23526 432 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ZP4Q12836 540 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 PPA1Q15181 289 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 OR7E24Q6IFN5 339 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 LINGO2Q7L985 606 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 TMEM123Q8N131 208 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 SGTBQ96EQ0 304 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 PLPPR2Q96GM1 343 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 NSMCE2Q96MF7 247 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 OR2M2Q96R28 347 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 MED29Q9NX70 200 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 TAS2R5Q9NYW4 299 aa18.16■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF587BE7ETH6 402 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 C11orf98E9PRG8 122 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 PIP5K1CO60331 668 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 SLC43A1O75387 559 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 OR7A10O76100 309 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 OR6A2O95222 327 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 HIST1H2ABP04908 130 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 NR1H2P55055 460 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 TGFBR3Q03167 851 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 TRAM2Q15035 370 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 PAMR1Q6UXH9 720 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 SSX8Q7RTT4 187 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ARHGAP24Q8N264 748 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 LIPHQ8WWY8 451 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 HIST1H2ACQ93077 130 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 MUCL1Q96DR8 90 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 TXNDC15Q96J42 360 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 C7orf34Q96L11 122 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 EMC6Q9BV81 110 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 NGBQ9NPG2 151 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 NDUFAF4Q9P032 175 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 V9GYQ6 96 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 AKAP9Q99996 3911 aa18.15■□□□□ 0.5
RNPS1-226ENST00000570051 CADP27708 2225 aa18.14■□□□□ 0.49
RNPS1-226ENST00000570051 SERPINI2O75830 405 aa18.14■□□□□ 0.49
RNPS1-226ENST00000570051 SEMG1P04279 462 aa18.14■□□□□ 0.49
RNPS1-226ENST00000570051 FUT1P19526 365 aa18.14■□□□□ 0.49
RNPS1-226ENST00000570051 VLDLRP98155 873 aa18.14■□□□□ 0.49
RNPS1-226ENST00000570051 CYP4Z1Q86W10 505 aa18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms