RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A0G2JPF8 293 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1B0GWA3 101 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 H7C417 338 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 M0R082 166 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 FKBP6O75344 327 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERPINI2O75830 405 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 WNT11O96014 354 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CELA3BP08861 270 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANPEPP15144 967 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 HTR2AP28223 471 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 EGR4Q05215 589 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPRL3Q12980 569 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 GGTLC2Q14390 218 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CARD17Q5XLA6 110 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF544Q6NX49 715 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPGNQ6UW88 154 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM168AQ92567 244 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 THTPAQ9BU02 230 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 RASD1Q9Y272 281 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 IFT52Q9Y366 437 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATRQ13535 2644 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A096LPI6 279 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 TPST1O60507 370 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPIPB7O75200 414 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRYAAP02489 173 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 OPN1SWP03999 348 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CECR9P0C854 216 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARAFP10398 606 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF43P17038 809 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRDX6P30041 224 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRPRP30550 384 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CALCRP30988 508 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAPZA2P47755 286 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 IDH3AP50213 366 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAP2K6P52564 334 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 EFNA4P52798 201 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACTR3P61158 418 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHRNB3Q05901 458 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 FADDQ13158 208 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCARB2Q14108 478 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGKQ53H12 422 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 FUNDC1Q8IVP5 155 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 STK35Q8TDR2 534 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 NRG4Q8WWG1 115 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAAR8Q969N4 342 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms