RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	PARP8	Q8N3A8	854 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	IFT27	Q9BW83	186 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	OR52D1	Q9H346	318 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	USE1	Q9NZ43	259 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	MEMO1	Q9Y316	297 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF716	A6NP11	495 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	HSPB2	A8KAH6	182 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF724	A8MTY0	619 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	SOCS2	O14508	198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	F13B	P05160	661 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	ALPL	P05186	524 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	CRH	P06850	196 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	YES1	P07947	543 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	GLI4	P10075	376 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	OSM	P13725	252 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	KLK2	P20151	261 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	POU1F1	P28069	291 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	P2RY4	P51582	365 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	RPS6KA3	P51812	740 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	HSPB2	Q16082	182 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC36A3	Q495N2	470 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	LPCAT4	Q643R3	524 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	KDM8	Q8N371	416 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	OR2T33	Q8NG76	320 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	RND1	Q92730	232 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	FANCF	Q9NPI8	374 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	IL20	Q9NYY1	176 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCD4-223	ENST00000555904	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF726	A6NNF4	738 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	MS4A18	H0YCH9	400 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	XKRY	O14609	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	RAMP1	O60894	148 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	PTP4A3	O75365	173 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	BCL10	O95999	233 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	CD14	P08571	375 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	TSPAN19	P0C672	248 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	IFNGR1	P15260	489 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	AGTR1	P30556	359 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	UQCRFS1	P47985	274 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	CTXN1	P60606	82 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	ESRRG	P62508	458 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	SIRPA	P78324	504 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	CASP12	Q6UXS9	341 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	FJX1	Q86VR8	437 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	RPRML	Q8N4K4	120 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	SAMD8	Q96LT4	415 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCD4-223	ENST00000555904	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63

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