RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 NCR1O76036 304 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 AHSA1O95433 338 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 RAB36O95755 333 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 DBIP07108 87 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 NUDT17P0C025 328 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 NAT2P11245 290 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 CD79AP11912 226 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 ZNF35P13682 527 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 CRHR1P34998 444 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 PLAURQ03405 335 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 FUT5Q11128 374 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 BAMBIQ13145 260 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 C1DQ13901 141 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 XKR7Q5GH72 579 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 ARMCX4Q5H9R4 360 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 C6orf136Q5SQH8 315 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 C1orf140Q5VVS0 124 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 WBP2NLQ6ICG8 309 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 CLECL1Q8IZS7 167 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 CLEC4FQ8N1N0 589 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 MFSD8Q8NHS3 518 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 STK35Q8TDR2 534 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 LRRC58Q96CX6 371 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 ZG16BQ96DA0 208 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 TBK1Q9UHD2 729 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 NUP50Q9UKX7 468 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 PPIAL4EA0A075B759 164 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 A0A1B0GUS0 222 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 C17orf100A8MU93 164 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 PPIAL4DF5H284 164 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 CLDN34H7C241 214 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 NPHS1O60500 1241 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 MT-ND5P03915 603 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 PPIAL4FP0DN26 164 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 CRYBB2P43320 205 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 ATP4BP51164 291 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 CLDN8P56748 225 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 FXNQ16595 210 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 MOGQ16653 247 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 MSMPQ1L6U9 139 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 FAM209AQ5JX71 171 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 AVPI1Q5T686 147 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 ANXA8L1Q5VT79 327 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 OR4F3Q6IEY1 312 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 HMGN2P46Q86SG4 172 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 LRP11Q86VZ4 500 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 PEX5LQ8IYB4 626 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 OR8J2Q8NGG1 315 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 ST7LQ8TDW4 575 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 MZB1Q8WU39 189 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 NEURL3Q96EH8 262 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 OXGR1Q96P68 337 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 GAL3ST1Q99999 423 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 DECR2Q9NUI1 292 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 B3GNT2Q9NY97 397 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 PLEK2Q9NYT0 353 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 OPN4Q9UHM6 478 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 WIPI2Q9Y4P8 454 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 COPEO14579 308 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 RIPK2O43353 540 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 CDC14BO60729 498 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 ENTPD5O75356 428 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 FOXH1O75593 365 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 UBL3O95164 117 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 HLA-HP01893 362 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 PNMTP11086 282 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 ECHS1P30084 290 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 MAGEB1P43366 347 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 HFEQ30201 348 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 UGT3A2Q3SY77 523 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 C10orf107Q8IVU9 208 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 CADM2Q8N3J6 435 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 SLC38A1Q9H2H9 487 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-228ENST00000551473 MMP27Q9H306 513 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms