RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548489.6

TGIF1-211, Transcript of TGFB induced factor homeobox 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TGIF1, Length 1,536 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1-211ENST00000548489 OR4K17Q8NGC6 315 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ZNF563Q8TA94 476 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 HAS2Q92819 552 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ARSGQ96EG1 525 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ZNF597Q96LX8 424 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 FNDC11Q9BVV2 318 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TRIM2Q9C040 744 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 PTGES2Q9H7Z7 377 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 PROK2Q9HC23 129 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 CTPS2Q9NRF8 586 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 SELENONQ9NZV5 590 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 RHCGQ9UBD6 479 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 RIMS3Q9UJD0 308 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ACAD8Q9UKU7 415 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 A4GNTQ9UNA3 340 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 IGF2RP11717 2491 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 A0A0G2JMM0 328 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 A0A1B0GWA3 101 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 A0A1W2PPB8 328 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 A0A1W2PPL8 197 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 A0A1W2PRS3 328 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ANKUB1A6NFN9 424 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TNFRSF11BO00300 401 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 FAAHO00519 579 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 FFAR1O14842 300 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 NME2P1O60361 137 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TPST2O60704 377 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 OR5F1O95221 314 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 SP1P08047 785 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 THRBP10828 461 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 DNASE1L1P49184 302 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TNFSF10P50591 281 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ARHGDIAP52565 204 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 LOXL3P58215 753 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ST3GAL3Q11203 375 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 GK3PQ14409 553 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TRAM2Q15035 370 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 QPRTQ15274 297 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 OR1Q1Q15612 314 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TRIP10Q15642 601 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 FGD3Q5JSP0 725 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TIGD3Q6B0B8 471 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 SLC25A25Q6KCM7 469 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ZADH2Q8N4Q0 377 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 LSMEM1Q8N8F7 131 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 FADS6Q8N9I5 356 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 WDSUB1Q8N9V3 476 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TMEM178AQ8NBL3 297 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 CATSPER1Q8NEC5 780 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 OR2M3Q8NG83 312 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 OR1J4Q8NGS1 313 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 OR52J3Q8NH60 311 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TMEM234Q8WY98 164 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 SDCCAG3Q96C92 435 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 NTNG2Q96CW9 530 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 DTNBP1Q96EV8 351 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 SLC41A3Q96GZ6 507 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TSC22D3Q99576 134 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 EPYCQ99645 322 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 DSN1Q9H410 356 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 KLHL1Q9NR64 748 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ACER3Q9NUN7 267 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 ASB6Q9NWX5 421 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 VNN3Q9NY84 501 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 MED11Q9P086 117 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 SLC7A7Q9UM01 511 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 U3KQV3 271 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 PCNX3Q9H6A9 2034 aa5.99□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa5.98□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 A0A087WWL8 130 aa5.98□□□□□ -1.45
TGIF1-211ENST00000548489 TRAV17A0A0B4J275 112 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms