RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542142.1

MMP17-208, Transcript of matrix metallopeptidase 17, human

TSL 4

Gene MMP17, Length 758 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MMP17-208	ENST00000542142	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142		B2RBV5	119 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	HLA-DOB	P13765	273 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	UGT2B15	P54855	530 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	PPA1	Q15181	289 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	GABRA6	Q16445	453 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	MPDZ	O75970	2070 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ENO4	A6NNW6	628 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	FFAR1	O14842	300 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SLC43A1	O75387	559 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	OR6A2	O95222	327 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	HIST1H2AB	P04908	130 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ADORA3	P0DMS8	318 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	CALB2	P22676	271 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	AHCY	P23526	432 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	LGALS3BP	Q08380	585 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ZP4	Q12836	540 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	TMEM123	Q8N131	208 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	PFN4	Q8NHR9	129 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	NINJ1	Q92982	152 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	OR2M2	Q96R28	347 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	MED31	Q9Y3C7	131 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142		J3KTA2	159 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	UPK3A	O75631	287 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	OR7A10	O76100	309 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	UMPS	P11172	480 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	TRAM2	Q15035	370 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	LIPH	Q8WWY8	451 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SGTB	Q96EQ0	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	RHCG	Q9UBD6	479 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	C11orf98	E9PRG8	122 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ARPC2	O15144	300 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	RNF13	O43567	381 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	PRSS23	O95084	383 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	RAF1	P04049	648 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	FUT1	P19526	365 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	FUT4	P22083	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	DNASE1	P24855	282 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	LINGO2	Q7L985	606 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	OR52N5	Q8NH56	324 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	PYURF	Q96I23	114 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	TXNDC15	Q96J42	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	C7orf34	Q96L11	122 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MMP17-208	ENST00000542142	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		13.73	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms