RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	JMJD7	P0C870	316 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GAA	P10253	952 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NPR2	P20594	1047 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PRKACB	P22694	351 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TAS2R19	P59542	299 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GPLD1	P80108	840 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CDC20	Q12834	499 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HTR4	Q13639	388 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ORAI1	Q96D31	301 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TSSK2	Q96PF2	358 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DDO	Q99489	341 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SRR	Q9GZT4	340 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RGCC	Q9H4X1	137 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LDAH	Q9H6V9	325 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CMC2	Q9NRP2	79 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM82	A0PJX8	343 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SSX5	O60225	188 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TGM1	P22735	817 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	S100A2	P29034	98 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CTH	P32929	405 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MELK	Q14680	651 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	AGER	Q15109	404 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OTP	Q5XKR4	325 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	BEND4	Q6ZU67	534 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MFSD4A	Q8N468	514 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PRRT1	Q99946	306 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DOCK1	Q14185	1865 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	C2orf72	A6NCS6	295 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR2W5	A6NFC9	320 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TNFRSF10A	O00220	468 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	UTS2	O95399	124 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HOXB5	P09067	269 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CCR9	P51686	369 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CDKN3	Q16667	212 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM215	Q68D42	235 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NIPAL3	Q6P499	406 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR52I2	Q8NH67	350 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TCTN2	Q96GX1	697 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM212	A6NML5	194 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	EFCAB7	A8K855	629 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	AKR7A2	O43488	359 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SUSD5	O60279	629 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PCMT1	P22061	227 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OTX2	P32243	289 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA1024L	P59773	190 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ACY1	Q03154	408 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FGL2	Q14314	439 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DUSP6	Q16828	381 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC190	Q86UF4	302 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NRTN	Q99748	197 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	WDR76	Q9H967	626 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MOK	Q9UQ07	419 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193		M0QYG6	137 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PRAMEF4	O60810	478 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	C1QB	P02746	253 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR8U9	P0C7N5	309 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22

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