RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD200R1	Q8TD46	325 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR87	Q9BY21	358 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR173	Q9NS66	373 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYOT	Q9UBF9	498 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCN7A	Q01118	1682 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1B0GV50	99 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ITGB1BP1	O14713	200 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAAR5	O14804	337 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GCG	P01275	180 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF286B	P0CG31	522 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	AMD1	P17707	334 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACKR3	P25106	362 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HTR1F	P30939	366 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LSS	P48449	732 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NFATC4	Q14934	902 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	C4orf36	Q96KX1	117 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRIB3	Q96RU7	358 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LHX9	Q9NQ69	397 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PS29	197 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	IQCF5	A8MTL0	148 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LILRB3	O75022	631 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM127	O75204	238 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	AKR1C4	P17516	323 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFV2	P19404	249 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GZMM	P51124	257 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HMGA2	P52926	109 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRKAG1	P54619	331 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GHSR	Q92847	366 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CASD1	Q96PB1	797 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRRT1	Q99946	306 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	WBP1L	Q9NX94	342 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPT2	Q9UMR5	302 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MOK	Q9UQ07	419 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRP5	O75197	1615 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	C2orf78	A6NCI8	922 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	AQP7	O14520	342 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TGM5	O43548	720 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LDB2	O43679	373 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAA	P10253	952 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACP5	P13686	325 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	AKT2	P31751	481 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR12D2	P58182	307 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SSPN	Q14714	243 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HMCES	Q96FZ2	354 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	WBP1	Q96G27	269 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TGM7	Q96PF1	710 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CREBZF	Q9NS37	354 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CKLF	Q9UBR5	152 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DVL1	O14640	695 aa		7.56	□□□□□ -1.2

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