RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492076.1

SLC20A1-208, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SLC20A1, Length 613 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-208ENST00000492076 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 ANP32DO95626 131 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 BCHEP06276 602 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 UQCRBP14927 111 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 CXCR1P25024 350 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 ETV4P43268 484 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 RPL14P50914 215 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 DSCR9P59020 149 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 PRPS1P60891 318 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 SLC35A1P78382 337 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 IL1RL1Q01638 556 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 TGFBR3Q03167 851 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 CHRNB3Q05901 458 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 LGALS3BPQ08380 585 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 STX3Q13277 289 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 GNA13Q14344 377 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 CASP8Q14790 479 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 PDK3Q15120 406 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 SMU1Q2TAY7 513 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 ATG16L1Q676U5 607 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 NXNQ6DKJ4 435 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 TMEM225Q6GV28 225 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 OR7E24Q6IFN5 339 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 NIPAL3Q6P499 406 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 AAED1Q7RTV5 226 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 SPATA19Q7Z5L4 167 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 VRK2Q86Y07 508 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 PEX5LQ8IYB4 626 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 TRIML2Q8N7C3 387 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 TMEM99Q8N816 258 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 WDR31Q8NA23 367 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 MIPOL1Q8TD10 442 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 MGARPQ8TDB4 240 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 TESCQ96BS2 214 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 SLC25A36Q96CQ1 311 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 NEURL3Q96EH8 262 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 TEX37Q96LM6 180 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 MUS81Q96NY9 551 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 OR52E6Q96RD3 313 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 ZBTB18Q99592 522 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 TAPBPLQ9BX59 468 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 JAM3Q9BX67 310 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 SLC17A5Q9NRA2 495 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 POLE3Q9NRF9 147 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 RLIMQ9NVW2 624 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 ASIC5Q9NY37 505 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 MALT1Q9UDY8 824 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 AMDHD2Q9Y303 409 aa5.65□□□□□ -1.5
SLC20A1-208ENST00000492076 A0A096LNT2 108 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 SH3PXD2BA1X283 911 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 AGAP5A6NIR3 686 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 C22orf46C9J442 243 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 NR5A2O00482 541 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 RFXANKO14593 260 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 DNPH1O43598 174 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 LGI1O95970 557 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 FSHBP01225 129 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 GPIP06744 558 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 FAM157CP0CG43 387 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 ETFAP13804 333 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 SLC25A16P16260 332 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 USF1P22415 310 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 CBLP22681 906 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 FPR2P25090 351 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 EPHA3P29320 983 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 MPGP29372 298 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 IL12AP29459 219 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 SLC1A3P43003 542 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 CRATP43155 626 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 HTR3AP46098 478 aa5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 CLK1P49759 484 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SLC20A1-208ENST00000492076 SELENOPP49908 381 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms