RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	CYP7B1	O75881	506 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF432	O94892	652 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	OR4F21	O95013	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	CSTA	P01040	98 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	PF4	P02776	101 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	GPI	P06744	558 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	CSF1	P09603	554 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	UQCRB	P14927	111 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	SELE	P16581	610 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	TAC1	P20366	129 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	HSD17B3	P37058	310 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	SERPINB8	P50452	374 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	DR1	Q01658	176 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	MVK	Q03426	396 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	CARM1	Q86X55	608 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	APIP	Q96GX9	242 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	CCDC188	H7C350	402 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	WNT9B	O14905	357 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	RAD51C	O43502	376 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	STX11	O75558	287 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	SUPT7L	O94864	414 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	LGI1	O95970	557 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	AGR2	O95994	175 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	IGHM	P01871	453 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	OPN1MW	P04001	364 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	GUSB	P08236	651 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF12	P17014	697 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	OMG	P23515	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	CRHR1	P34998	444 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	ASMT	P46597	345 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	LCN2	P80188	198 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	BTK	Q06187	659 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	EGR3	Q06889	387 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	NPRL3	Q12980	569 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF154	Q13106	437 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF141	Q15928	474 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP170-216	ENST00000490813	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms