RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490753.1

NOP56-215, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-215ENST00000490753 OR52N5Q8NH56 324 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 TFAP2CQ92754 450 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 C1orf159Q96HA4 380 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 EGLN2Q96KS0 407 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 INPP5KQ9BT40 448 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 PRR14Q9BWN1 585 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.51□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 A0A1W2PR80 420 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 M0R1B8 84 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 KIAA0513O60268 411 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 CYTIPO60759 359 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 IGHV3-9P01782 118 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 NPIPA8P0DM63 369 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 PRKCAP17252 672 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 PTAFRP25105 342 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 LCN1P31025 176 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 RAC3P60763 192 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 CHRNEQ04844 493 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 APOFQ13790 326 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 FXNQ16595 210 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 RFX4Q33E94 735 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 SLC36A3Q495N2 470 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 LIPNQ5VXI9 398 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ZNF544Q6NX49 715 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 SERPINA11Q86U17 422 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 OR7A2PQ8NGA2 310 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 OR52E4Q8NGH9 312 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 C3orf49Q96BT1 292 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ZNF524Q96C55 264 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 PPCDCQ96CD2 204 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 NRBF2Q96F24 287 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 PYURFQ96I23 114 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 RDH12Q96NR8 316 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 NTMQ9P121 344 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 BTNL2Q9UIR0 455 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ZNF724A8MTY0 619 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 FABP3P05413 133 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ALOX5P09917 674 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ITGA2P17301 1181 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 SOAT1P35610 550 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 CDKN2CP42773 168 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 NR4A2P43354 598 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 PDLIM4P50479 330 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 P2RX1P51575 399 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 IL1RL1Q01638 556 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 VMACQ2NL98 169 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 CR1LQ2VPA4 569 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 OR8J2Q8NGG1 315 aa8.49□□□□□ -1.05
NOP56-215ENST00000490753 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms