RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 HDXQ7Z353 690 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ARMC8Q8IUR7 673 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 GPR32P1Q8NGA4 272 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 OR6S1Q8NH40 331 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 SLC47A1Q96FL8 570 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 MOGAT1Q96PD6 335 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 OR2M2Q96R28 347 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF607Q96SK3 696 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 RABEP2Q9H5N1 569 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 A0A096LPE4 126 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PPZ6 126 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CRLF1O75462 422 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 HLA-DOBP13765 273 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CBLP22681 906 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CDH12P55289 794 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 MTPNP58546 118 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 NPTX1Q15818 432 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 DUSP7Q16829 419 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 C3orf36Q3SXR2 165 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 LINC00114Q6XXX2 140 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CGREF1Q99674 301 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGDIGQ99819 225 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 KATNB1Q9BVA0 655 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 GPR35Q9HC97 309 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 RTTNQ86VV8 2226 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 ATRQ13535 2644 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CD5LO43866 347 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 GPRIN2O60269 458 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 SERPINB7O75635 380 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 IGKV3-15P01624 115 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CECR9P0C854 216 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 ARF1P84077 181 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 HMBOX1Q6NT76 420 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF525Q8N782 197 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 FAM169BQ8N8A8 192 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 SMYD1Q8NB12 490 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 C11orf65Q8NCR3 313 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 ANGPT4Q9Y264 503 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFAF1Q9Y375 327 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 LRRN3E7EW58 273 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 SLC43A1O75387 559 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 SASH3O75995 380 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 LYPD3O95274 346 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CALCRP30988 508 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 GZMMP51124 257 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 NAAAQ02083 359 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 RAB35Q15286 201 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 OR4D11Q8NGI4 311 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 TSPEARQ8WU66 669 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 RHNO1Q9BSD3 238 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM43Q9BTV4 400 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 EVA1AQ9H8M9 152 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM27Q9HBJ8 222 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 NPHS2Q9NP85 383 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 M0R3H8 397 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 LY6HO94772 140 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 THY1P04216 161 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CELA3BP08861 270 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 PAX7P23759 505 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CRYBA2P53672 197 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 RBBP4Q09028 425 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CEACAM16Q2WEN9 425 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 WDR88Q6ZMY6 472 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 SCAIQ8N9R8 606 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CORINQ9Y5Q5 1042 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 FMO6PO60774 539 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 OPN1SWP03999 348 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 EFNA4P52798 201 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 DSCR9P59020 149 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 NCALDP61601 193 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 C1DQ13901 141 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 MFSD13AQ14CX5 517 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC2AQ6UVW9 174 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 OR6T1Q8NGN1 323 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 C10orf105Q8TEF2 133 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 MDFIQ99750 246 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CRLF2Q9HC73 371 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CA10Q9NS85 328 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 COL6A5A8TX70 2615 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 MXRA5Q9NR99 2828 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 M0QX08 132 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 FBP2O00757 339 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 C8BP07358 591 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CD247P20963 164 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 HGFACQ04756 655 aa24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms