RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489571.5

PGAP2-223, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 2

Gene PGAP2, Length 879 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-223	ENST00000489571	TUBA4A	P68366	448 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CHRNB3	Q05901	458 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	OR1Q1	Q15612	314 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	TUBA1A	Q71U36	451 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	RETREG3	Q86VR2	466 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	OR6S1	Q8NH40	331 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	RNF217	Q8TC41	542 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	EPYC	Q99645	322 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	SELENON	Q9NZV5	590 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571		A0A096LNT2	108 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	ANGPT2	O15123	496 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CD5L	O43866	347 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CRLF1	O75462	422 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	IGLV1-44	P01699	117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	BGLAP	P02818	100 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	BMP4	P12644	408 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CBL	P22681	906 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	MTPN	P58546	118 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	IL1RL1	Q01638	556 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	RBBP4	Q09028	425 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	SELPLG	Q14242	412 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CYP51A1	Q16850	503 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF525	Q8N782	197 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	SMYD1	Q8NB12	490 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	OR2M2	Q96R28	347 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CGREF1	Q99674	301 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	GPR35	Q9HC97	309 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	NPHS2	Q9NP85	383 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	MS4A18	H0YCH9	400 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571		M0R3H8	397 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	FMO6P	O60774	539 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	HPR	P00739	348 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CRYAA	P02489	173 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CECR9	P0C854	216 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	EFNA4	P52798	201 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CDH12	P55289	794 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	NAAA	Q02083	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	UEVLD	Q8IX04	471 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	TMEM123	Q8N131	208 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	SCAI	Q8N9R8	606 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	ASPN	Q9BXN1	380 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CRLF2	Q9HC73	371 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	IGKV3-15	P01624	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	OPN1SW	P03999	348 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	HLA-DOB	P13765	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	NFYC	Q13952	458 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	DUSP7	Q16829	419 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF613	Q6PF04	617 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM168A	Q92567	244 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	MCHR1	Q99705	422 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	CA10	Q9NS85	328 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PGAP2-223	ENST00000489571	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21

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