RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 PCDHB10Q9UN67 800 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 TRAV27A0A087WT01 109 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 OR14I1A6ND48 311 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 CRYBA1P05813 215 aa12.36□□□□□ -0.43
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NISCH-212ENST00000488380 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 HYAL4Q2M3T9 481 aa12.36□□□□□ -0.43
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NISCH-212ENST00000488380 THSD4Q6ZMP0 1018 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 OR1S2Q8NGQ3 325 aa12.36□□□□□ -0.43
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NISCH-212ENST00000488380 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
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NISCH-212ENST00000488380 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
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NISCH-212ENST00000488380 OR13C2Q8NGS9 318 aa12.35□□□□□ -0.43
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NISCH-212ENST00000488380 H3F3CQ6NXT2 135 aa12.35□□□□□ -0.43
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NISCH-212ENST00000488380 RPA2P15927 270 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 PDZK1IP1Q13113 114 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 GPM6BQ13491 265 aa12.34□□□□□ -0.43
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NISCH-212ENST00000488380 OR14C36Q8NHC7 312 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 GLYATL2Q8WU03 294 aa12.34□□□□□ -0.43
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NISCH-212ENST00000488380 TREM1Q9NP99 234 aa12.34□□□□□ -0.43
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NISCH-212ENST00000488380 C14orf105Q9NVL8 296 aa12.34□□□□□ -0.43
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NISCH-212ENST00000488380 CDK5R1Q15078 307 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 TMEM71Q6P5X7 295 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 NUDT18Q6ZVK8 323 aa12.34□□□□□ -0.43
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NISCH-212ENST00000488380 OR4C16Q8NGL9 310 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 OR2L8Q8NGY9 312 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 ADAMTS15Q8TE58 950 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 TCEAL3Q969E4 200 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SEC22AQ96IW7 307 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 TMEM231Q9H6L2 316 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 CES1P1Q9UKY3 287 aa12.34□□□□□ -0.43
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