RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 C1QL4Q86Z23 238 aa8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 CDK20Q8IZL9 346 aa8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 JMJD8Q96S16 334 aa8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 PTDSS2Q9BVG9 487 aa8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 PNPOQ9NVS9 261 aa8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 RCE1Q9Y256 329 aa8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.13□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A096LPI6 279 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 SDHDO14521 159 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF432O94892 652 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 AHSA1O95433 338 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 BCHEP06276 602 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 LYNX1P0DP58 116 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 HKR1P10072 659 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 BGNP21810 368 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 CLDN17P56750 224 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 HOXC5Q00444 222 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 RIN1Q13671 783 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 MPP2Q14168 576 aa8.12□□□□□ -1.11
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SMARCE1-210ENST00000481231 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ATG16L1Q676U5 607 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 MDP1Q86V88 176 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF786Q8N393 782 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 STK35Q8TDR2 534 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM186Q96B77 213 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A36Q96CQ1 311 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ZBTB18Q99592 522 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR35Q9HC97 309 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 MED29Q9NX70 200 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR45Q9Y5Y3 372 aa8.12□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 VSTM5A8MXK1 200 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 B4DSR2 109 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 RFXANKO14593 260 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 FZD7O75084 574 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC43A1O75387 559 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 SEC14L2O76054 403 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 AVPP01185 164 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ADRA2AP08913 450 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 IFNGR1P15260 489 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF43P17038 809 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 EPHA3P29320 983 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ARR3P36575 388 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 CRATP43155 626 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 CRISP3P54108 245 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 IL1RL1Q01638 556 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 EGR4Q05215 589 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 BST1Q10588 318 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 NPRL3Q12980 569 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 STX3Q13277 289 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 ADRM1Q16186 407 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 MSMPQ1L6U9 139 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 KRT71Q3SY84 523 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 GTDC1Q4AE62 458 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 FBLN7Q53RD9 439 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM123Q8N131 208 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 VPS33AQ96AX1 596 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM19Q96HH6 336 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 DUX5Q96PT3 197 aa8.11□□□□□ -1.11
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2M2Q96R28 347 aa8.11□□□□□ -1.11
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