RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MT-ND1P03886 318 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 IFNW1P05000 195 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ASAH2BP0C7U1 165 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 NR1H2P55055 460 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 NCMAPQ5T1S8 102 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 OR7E24Q6IFN5 339 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 C16orf89Q6UX73 402 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 FKBP9P1Q75LS8 142 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 LINGO2Q7L985 606 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 PFN4Q8NHR9 129 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 TMEM239Q8WW34 195 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 MUCL1Q96DR8 90 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 NSL1Q96IY1 281 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 HS6ST2Q96MM7 605 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 TMEM204Q9BSN7 226 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 LINC00470Q9BZP3 86 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 NANSQ9NR45 359 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R5Q9NYW4 299 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ZNF229Q9UJW7 825 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 RPS6KA6Q9UK32 745 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ROS1P08922 2347 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ENO4A6NNW6 628 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 FFAR1O14842 300 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ATE1O95260 518 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 PLAUP00749 431 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ADORA3P0DMS8 318 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 MNAT1P51948 309 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ST3GAL3Q11203 375 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ZP4Q12836 540 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 TESK1Q15569 626 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 SSX8Q7RTT4 187 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 PXKQ7Z7A4 578 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 DEFB107AQ8IZN7 70 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 TMEM123Q8N131 208 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 WDR31Q8NA23 367 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 TXNDC15Q96J42 360 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 OR2M2Q96R28 347 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 GORASP2Q9H8Y8 452 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 NGBQ9NPG2 151 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 C20orf141Q9NUB4 165 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 NDE1Q9NXR1 346 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 NPAP1Q9NZP6 1156 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 NOX1Q9Y5S8 564 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A15Q9Y619 301 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PR80 420 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 DPRXA6NFQ7 191 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 B2RBV5 119 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ZNF587BE7ETH6 402 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 SLC43A1O75387 559 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 KRT33AO76009 404 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 PRSS23O95084 383 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 IGF2P01344 180 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 RAF1P04049 648 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 AHCYP23526 432 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 DNASE1P24855 282 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 MXRA7P84157 204 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 WDFY1Q8IWB7 410 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 OFCC1Q8IZS5 231 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 OR52N5Q8NH56 324 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 BOD1Q96IK1 185 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 EMC6Q9BV81 110 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 SLC17A5Q9NRA2 495 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 MED29Q9NX70 200 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 RHCGQ9UBD6 479 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 EDARQ9UNE0 448 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 C11orf98E9PRG8 122 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 T-ENOLP0DO92 83 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 FUT1P19526 365 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 IFNA8P32881 189 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.539e-19■■■■■ 27
ACTB-211ENST00000480301 TGFBR3Q03167 851 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 C17orf78Q8N4C9 275 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 FAM86B1Q8N7N1 296 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 LIPHQ8WWY8 451 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 SGTBQ96EQ0 304 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 FNDC11Q9BVV2 318 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 SLC35F4A4IF30 521 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 PIP5K1CO60331 668 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 GMNNO75496 209 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 SERPINI2O75830 405 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 OR7A10O76100 309 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-211ENST00000480301 OR6A2O95222 327 aa18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms